RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 HYLS1Q96M11 299 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ASB4Q9Y574 426 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 CEBPGP53567 150 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 GRK1Q15835 563 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 OR4C15Q8NGM1 316 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 OR7D2Q96RA2 312 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 TRAPPC6AO75865 159 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 FUT1P19526 365 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 UGT2B10P36537 528 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 MMP12P39900 470 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 MGAT4CQ9UBM8 478 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PDSS1Q5T2R2 415 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 OR5W2Q8NH69 310 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 SGCDQ92629 289 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 OR52D1Q9H346 318 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 SACM1LQ9NTJ5 587 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 HIDE1A8MVS5 230 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 RDH16O75452 317 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 MAS1P04201 325 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 TNFSF8P32971 234 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 TBC1D15Q8TC07 691 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM163Q8TC26 289 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 A0A0J9YY10 115 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 CTDSP2O14595 271 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ZER1Q7Z7L7 766 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 BMFQ96LC9 184 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 EPHX3Q9H6B9 360 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa16.57■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 RP2O75695 350 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 APOC1P02654 83 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PITPNBP48739 271 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PFN3P60673 137 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 DCST2Q5T1A1 773 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 LRIF1Q5T3J3 769 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 RAB12Q6IQ22 244 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 Q6ZSR6 202 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 TAS2R8Q9NYW2 309 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 NHSQ6T4R5 1651 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 GASTP01350 101 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 NPIPA8P0DM63 369 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 DRD1P21728 446 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 S100A10P60903 97 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 CTBSQ01459 385 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 OCLNQ16625 522 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 TP53I3Q53FA7 332 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PDFQ9HBH1 243 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PEX12O00623 359 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 LDB3O75112 727 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 LHCGRP22888 699 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 VAMP2P63027 116 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PGGHGQ32M88 737 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 INAVAQ3KP66 663 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 FCRLBQ6BAA4 426 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ULK3Q6PHR2 472 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 VRK2Q86Y07 508 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 OR5L2Q8NGL0 311 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ARRDC3Q96B67 414 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 VNN3Q9NY84 501 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 DKKL1Q9UK85 242 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 IL1AP01583 271 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 SMIM18P0DKX4 95 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 GLP1RP43220 463 aa16.56■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ENTPD8Q5MY95 495 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms