RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 CFL2Q9Y281 166 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PPW3 197 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SNPHO15079 494 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 VILLO15195 856 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SSX5O60225 188 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF12P17014 697 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 LIM2P55344 173 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 RAB38P57729 211 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 LHPPQ9H008 270 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 FAIMQ9NVQ4 179 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 EBF1Q9UH73 591 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SGK494L7N484 410 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SYT5O00445 386 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 TRAPPC6AO75865 159 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 IFI30P13284 250 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF3P17036 446 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 GINS1Q14691 196 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CDC73Q6P1J9 531 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 OR2A14Q96R47 310 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PRRX2Q99811 253 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PRODH2Q9UF12 536 aa9.94□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CLCA1A8K7I4 914 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 AQP9O43315 295 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 LDB3O75112 727 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ST3GAL4Q11206 333 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 FRMPD2BQ6IN97 320 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 FAHD1Q6P587 224 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 OSTF1Q92882 214 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 A8MVJ9 347 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SULT1B1O43704 296 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CNR2P34972 360 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 TCEANCQ8N8B7 351 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 OR5M3Q8NGP4 307 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CDS1Q92903 461 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 RIT1Q92963 219 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PEX11GQ96HA9 241 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 INMTO95050 263 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 IFNGP01579 166 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 MAP2K4P45985 399 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF846Q147U1 533 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 LTB4RQ15722 352 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SLC27A4Q6P1M0 643 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 VWA5B2Q8N398 1253 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CADM2Q8N3J6 435 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 FRMD1Q8N878 549 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 G6PC3Q9BUM1 346 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 STARD5Q9NSY2 213 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ACER3Q9NUN7 267 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF224Q9NZL3 707 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 RNF6Q9Y252 685 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 MPLP40238 635 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 RAB15P59190 212 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CHRNEQ04844 493 aa9.93□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SYT16Q17RD7 645 aa9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms