RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237014.7

TTR-201, Transcript of transthyretin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTR, Length 957 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-201ENST00000237014 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 GLI4P10075 376 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 BMP7P18075 431 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 AGAP20933 346 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 PRPS1L1P21108 318 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 ACVR2AP27037 513 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 EPHA3P29320 983 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 IL12AP29459 219 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 GABRA3P34903 492 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 ADH7P40394 386 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 RFX3P48380 749 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 PRKAG1P54619 331 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 HBA1P69905 142 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 PSPHP78330 225 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 EFR3AQ14156 821 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 DECR1Q16698 335 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 CCNJQ5T5M9 372 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 CPTPQ5TA50 214 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 VASNQ6EMK4 673 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 OGFOD2Q6N063 350 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 XKRXQ6PP77 449 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 SZRD1Q7Z422 152 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 FADS6Q8N9I5 356 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 ACBD4Q8NC06 268 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 FAM110BQ8TC76 370 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 SLC9A6Q92581 669 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 SARAFQ96BY9 339 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 TMCO6Q96DC7 493 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 DOCK7Q96N67 2140 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 TIMP4Q99727 224 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 DUSP26Q9BV47 211 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 LDAHQ9H6V9 325 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 EXO5Q9H790 373 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 Q9N2J8 555 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 AIG1Q9NVV5 245 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 THAP1Q9NVV9 213 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 RNF6Q9Y252 685 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.63□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 A0A0G2JNJ9 132 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 TTC36A6NLP5 189 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 KLF11O14901 512 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 HDAC3O15379 428 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 ZIC3O60481 467 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 WDR1O75083 606 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 TRAPPC6AO75865 159 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 KCNK2O95069 426 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 UTS2O95399 124 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 CLDN14O95500 239 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 KITP10721 976 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 PRF1P14222 555 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 LBPP18428 481 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 HTR1EP28566 365 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 SRD5A2P31213 254 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 KRT20P35900 424 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 KIR3DL1P43629 444 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 SMSP52788 366 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 GFRA1P56159 465 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 UFM1P61960 85 aa6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TTR-201ENST00000237014 PRR5P85299 388 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms