RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
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SGMS1-210ENST00000619438 ENAMQ9NRM1 1142 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ACER3Q9NUN7 267 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 C5AR2Q9P296 337 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 MATN1P21941 496 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 EPHA2P29317 976 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 NTSP30990 170 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 FOLR3P41439 243 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 CDH12P55289 794 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 TEKQ02763 1124 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 TGM3Q08188 693 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SLAMF1Q13291 335 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 MAPK11Q15759 364 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 PRTGQ2VWP7 1150 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 OVCH1Q7RTY7 1134 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SLC5A8Q8N695 610 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 RAB2BQ8WUD1 216 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 MOAP1Q96BY2 351 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 YIPF2Q9BWQ6 316 aa20.03■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 C4orf51C9J302 202 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ATE1O95260 518 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 BCHEP06276 602 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 OTX2P32243 289 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 EMP3P54852 163 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SSPNQ14714 243 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 NDUFA9Q16795 377 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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SGMS1-210ENST00000619438 PARP8Q8N3A8 854 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 THAP11Q96EK4 314 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 SLC22A11Q9NSA0 550 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 ENOPH1Q9UHY7 261 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 CES1P1Q9UKY3 287 aa20.02■□□□□ 0.8
SGMS1-210ENST00000619438 A0A0G2JN53 185 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1W2PR48 441 aa20.01■□□□□ 0.79
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SGMS1-210ENST00000619438 RPS26P62854 115 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC35G5Q96KT7 338 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF607Q96SK3 696 aa20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 SERHL2Q9H4I8 314 aa20.01■□□□□ 0.79
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SGMS1-210ENST00000619438 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 SH3GLB1Q9Y371 365 aa20.01■□□□□ 0.79
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SGMS1-210ENST00000619438 XPNPEP2O43895 674 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 C1QL1O75973 258 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 KCNJ5P48544 419 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 OCA2Q04671 838 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 CAMKVQ8NCB2 501 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 MIPOL1Q8TD10 442 aa20■□□□□ 0.79
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SGMS1-210ENST00000619438 GAL3ST3Q96A11 431 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 FKBP10Q96AY3 582 aa20■□□□□ 0.79
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SGMS1-210ENST00000619438 BBS4Q96RK4 519 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 BCL7BQ9BQE9 202 aa20■□□□□ 0.79
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SGMS1-210ENST00000619438 ARGFXA6NJG6 315 aa20■□□□□ 0.79
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SGMS1-210ENST00000619438 MED26O95402 600 aa20■□□□□ 0.79
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SGMS1-210ENST00000619438 ACVR2AP27037 513 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 FMO3P31513 532 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 KHKP50053 298 aa20■□□□□ 0.79
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SGMS1-210ENST00000619438 TP53BP2Q13625 1128 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 NPTX1Q15818 432 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 SLC48A1Q6P1K1 146 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 ENTHD1Q8IYW4 607 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 GPR32P1Q8NGA4 272 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 FAR1Q8WVX9 515 aa20■□□□□ 0.79
SGMS1-210ENST00000619438 DTNBP1Q96EV8 351 aa20■□□□□ 0.79
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