RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 SEMA3GQ9NS98 782 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRE2Q9UHX3 823 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PLPP1O14494 284 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 GNGT2O14610 69 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 MYO1DO94832 1006 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 CLDN9O95484 217 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 OCM2P0CE71 109 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 HMGCS1Q01581 520 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 RHAGQ02094 409 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 RELAQ04206 551 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 MOGQ16653 247 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PAGE2BQ5JRK9 111 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 TCTN3Q6NUS6 607 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 DCDC5Q6ZRR9 648 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD37Q7Z713 158 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF321PQ8N8H1 164 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2L5Q8NG80 312 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 OR8H1Q8NGG4 311 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 SARGQ9BW04 601 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 DMRT3Q9NQL9 472 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 EXD2Q9NVH0 621 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM118AQ9NWS6 357 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 GPRC5BQ9NZH0 403 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 NME6O75414 186 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 OR5F1O95221 314 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PLA2G2AP14555 144 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 JAK1P23458 1154 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 RRADP55042 308 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 LIM2P55344 173 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF33BQ06732 778 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.553e-7■■■■□ 25.6
RABGEF1-209ENST00000607882 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF750Q32MQ0 723 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 GTDC1Q4AE62 458 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SPANXN4Q5MJ08 99 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SPARTQ8N0X7 666 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PSD4Q8NDX1 1056 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 OR8J3Q8NGG0 315 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 UBTD2Q8WUN7 234 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 NCLNQ969V3 563 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC47A1Q96FL8 570 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 MBOAT4Q96T53 435 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 GHITMQ9H3K2 345 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ATG4BQ9Y4P1 393 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 U3KQV3 271 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 POLEQ07864 2286 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 B3GALT2O43825 422 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 TMPRSS11DO60235 418 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CLEC3AO75596 197 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 WISP2O76076 250 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PDYNP01213 254 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 IFNA16P05015 189 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 HTR1AP08908 422 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKACGP22612 351 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 UQCRFS1P47985 274 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SLAMF1Q13291 335 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 MAPKAPK3Q16644 382 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 GRHL2Q6ISB3 625 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CLHC1Q8NHS4 586 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PSMF1Q92530 271 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 GTF2H4Q92759 462 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM162AQ96A26 154 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM10Q96HG1 83 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 UGT2B28Q9BY64 529 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 HES7Q9BYE0 225 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 MALT1Q9UDY8 824 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PSME2Q9UL46 239 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 HRKO00198 91 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SUV39H1O43463 412 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 HS6ST1O60243 411 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKD3O94806 890 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 OTCP00480 354 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 RNH1P13489 461 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP2R2BQ00005 443 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CD47Q08722 323 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA0040Q15053 153 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 C6orf141Q5SZD1 244 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC23Q5W5X9 447 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms