RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	KRT34	O76011	436 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	SNX4	O95219	450 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	FREM3	P0C091	2139 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	NPIPA8	P0DM63	369 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	IGFBP7	Q16270	282 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	GPAT3	Q53EU6	434 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	ZAR1	Q86SH2	424 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	PHF12	Q96QT6	1004 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	PROK2	Q9HC23	129 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		22.83	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	ASNA1	O43681	348 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	AK1	P00568	194 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	ETFA	P13804	333 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	PTPN6	P29350	595 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	TOMM20	Q15388	145 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF614	Q8N883	585 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	FAM110B	Q8TC76	370 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		22.82	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	HMGN4	O00479	90 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	SCD	O00767	359 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	MRAS	O14807	208 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	SLC22A2	O15244	555 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	MST1	P26927	711 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	GDF1	P27539	372 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	PTGDS	P41222	190 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	DSTN	P60981	165 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	SNTA1	Q13424	505 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	GPR68	Q15743	365 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	REP15	Q6BDI9	236 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	RETREG3	Q86VR2	466 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	ATCAY	Q86WG3	371 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	GATS	Q8NAP1	163 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	VAPA	Q9P0L0	249 aa		22.81	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	UNC5C	O95185	931 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	MAGEA5	P43359	124 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	MARCH3	Q86UD3	253 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF527	Q8NB42	609 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	MIB2	Q96AX9	1013 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	ROPN1L	Q96C74	230 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	SDF2	Q99470	211 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		22.8	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM247	A6NEH6	219 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	EVPLL	A8MZ36	301 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	FBP2	O00757	339 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	SNPH	O15079	494 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	GMFG	O60234	142 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	STX11	O75558	287 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	FAM107A	O95990	144 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	NR2F1	P10589	423 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	DCT	P40126	519 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	FOXO1	Q12778	655 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	DPP10	Q8N608	796 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		22.79	■■□□□ 1.24
GPS1-223	ENST00000584229	EXO5	Q9H790	373 aa		22.79	■■□□□ 1.24

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