RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580948.1

LINC00511-211, long intergenic non-protein coding RNA 511, humanhuman

TSL 3

Gene LINC00511, Length 475 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00511-211ENST00000580948 PIK3R3Q92569 461 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 SLC9A6Q92581 669 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 TMEM41AQ96HV5 264 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CCDC115Q96NT0 180 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 UBQLN3Q9H347 655 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 MED4Q9NPJ6 270 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 FLRT3Q9NZU0 649 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 ZIM2Q9NZV7 527 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 GTF3C1Q12789 2109 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 MED12Q93074 2177 aa8.44□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 A0A1B0GTH9 108 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 A0A1B0GVC2 190 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 C2orf72A6NCS6 295 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 C17orf51A8MQB3 221 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CCL21O00585 134 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 SNPHO15079 494 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 ATP8B1O43520 1251 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 SLC22A3O75751 556 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 KCNK2O95069 426 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 UTS2O95399 124 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 C1QCP02747 245 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 PGRP06401 933 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 PTPN6P29350 595 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 EVI2BP34910 448 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 SOAT1P35610 550 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 KRT20P35900 424 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CA7P43166 264 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 PRIM2P49643 509 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 SLC10A1Q14973 349 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 C3AR1Q16581 482 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 TIGD3Q6B0B8 471 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CDC73Q6P1J9 531 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 XKRXQ6PP77 449 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 ACAD11Q709F0 780 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 GALNT10Q86SR1 603 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CDH24Q86UP0 819 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 PACS2Q86VP3 889 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CLEC4FQ8N1N0 589 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 COX18Q8N8Q8 333 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 OR4A15Q8NGL6 344 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 MOAP1Q96BY2 351 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 TMCO6Q96DC7 493 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 GNRHR2Q96P88 292 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 STACQ99469 402 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 INPP5KQ9BT40 448 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 BTBD2Q9BX70 525 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 SERHLQ9NQF3 203 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 BTNL2Q9UIR0 455 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 TINAGQ9UJW2 476 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 KCNE3Q9Y6H6 103 aa8.43□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 GNB5O14775 395 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 SUSD5O60279 629 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 HCN1O60741 890 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 KCNH1O95259 989 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 NGFRP08138 427 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 ALOX5P09917 674 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CD1EP15812 388 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 GDF1P27539 372 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 PTGS2P35354 604 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CDKN2CP42773 168 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 MASP1P48740 699 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 GUCY1A3Q02108 690 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 RBPJQ06330 500 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 CDSNQ15517 529 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.42□□□□□ -1.06
LINC00511-211ENST00000580948 EMC4Q5J8M3 183 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms