RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 LRRC46Q96FV0 321 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 MAGEB18Q96M61 343 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 SFXN2Q96NB2 322 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 CCT8L2Q96SF2 557 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF559Q9BR84 538 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 CALHM2Q9HA72 323 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 EQTNQ9NQ60 294 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 SH3BP4Q9P0V3 963 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ABCG2Q9UNQ0 655 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.12□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFAB1O14561 156 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 FADS1O60427 444 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 IL33O95760 270 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 BPGMP07738 259 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 PRPS2P11908 318 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 DPP4P27487 766 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 GABRA3P34903 492 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 HPCAL1P37235 193 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 RFX3P48380 749 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 CLK3P49761 638 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ASCL1P50553 236 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 SEC24CP53992 1094 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 MANFP55145 182 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 GFRA1P56159 465 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 DLX5P56178 289 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 WDR4P57081 412 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 DMTNQ08495 405 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 VPS26BQ4G0F5 336 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 XKR7Q5GH72 579 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 SZRD1Q7Z422 152 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 CEP70Q8NHQ1 597 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ZPLD1Q8TCW7 415 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 MGARPQ8TDB4 240 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 MTERF3Q96E29 417 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 TUBA1CQ9BQE3 449 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 SDHAF3Q9NRP4 125 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 L3MBTL1Q9Y468 752 aa13.11□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 PEX11AO75192 247 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 KCNH1O95259 989 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 DRD4P21917 467 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 CHMP24386 653 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 UQCRC1P31930 480 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 RPL3P39023 403 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 PEX19P40855 299 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 FRKP42685 505 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF136P52737 540 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 PRKAG1P54619 331 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 SRYQ05066 204 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 STX5Q13190 355 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 HHATQ5VTY9 493 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 CES4AQ5XG92 561 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ARSKQ6UWY0 536 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 FADS6Q8N9I5 356 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 NUP43Q8NFH3 380 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 OR2M3Q8NG83 312 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 GPR151Q8TDV0 419 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 MS4A4EQ96PG1 132 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 DSN1Q9H410 356 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 FLRT3Q9NZU0 649 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 DOCK7Q96N67 2140 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 GXYLT2A0PJZ3 443 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 C17orf51A8MQB3 221 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 SYT5O00445 386 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ZIC3O60481 467 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 NKX2-2O95096 273 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 UTS2O95399 124 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 CTSSP25774 331 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ARRB2P32121 409 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ETV4P43268 484 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 STARP49675 285 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 LHX2P50458 406 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 DGKQP52824 942 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 GANABQ14697 944 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 ZSCAN26Q16670 478 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 CPLX4Q7Z7G2 160 aa13.09□□□□□ -0.31
CMTM3-215ENST00000568477 CDH24Q86UP0 819 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms