RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PDX1	P52945	283 aa		17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP69	Q49AA0	526 aa		17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf27A	Q580R0	203 aa		17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	RDH10	Q8IZV5	341 aa		17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	LCN9	Q8WX39	176 aa		17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	ASB6	Q9NWX5	421 aa		17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	POLH	Q9Y253	713 aa		17.21	■□□□□ 0.35
RRN3-205	ENST00000563559	PRR23A	A6NEV1	266 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	CENPX	A8MT69	81 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	FCMR	O60667	390 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1E1	P36543	226 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	IFITM2	Q01629	132 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	SHF	Q7M4L6	423 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ASPG	Q86U10	573 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf74	Q86VG3	221 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	PAQR7	Q86WK9	346 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	SYT14	Q8NB59	555 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	NT5C	Q8TCD5	201 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	WDR45	Q9Y484	360 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	CH25H	O95992	272 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	IGFALS	P35858	605 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF17	Q02223	184 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	LTB4R	Q15722	352 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	MZT2A	Q6P582	158 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	GID4	Q8IVV7	300 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf90	Q96M02	699 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		17.2	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	THBS1	P07996	1170 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	GPR4	P46093	362 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	HTRA3	P83110	453 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	BDH1	Q02338	343 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	GPM6B	Q13491	265 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	OR2L13	Q8N349	312 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	OR7G2	Q8NG99	324 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	TP53INP1	Q96A56	240 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		17.19	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	CEL	P19835	753 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	CPN2	P22792	545 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	HOXC5	Q00444	222 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP8	Q13202	625 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	KCT2	Q8NC54	265 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ENKUR	Q8TC29	256 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	CDS1	Q92903	461 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	FRMD6	Q96NE9	622 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	OR2M4	Q96R27	311 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	SERINC2	Q96SA4	455 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	URAD	A6NGE7	173 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DQB1	P01920	261 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	TRIQK	Q629K1	86 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	17.18	■□□□□ 0.34
RRN3-205	ENST00000563559	COL26A1	Q96A83	441 aa		17.18	■□□□□ 0.34

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