RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	SOX30	O94993	753 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZNF708	P17019	499 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PRPS1L1	P21108	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GABRA3	P34903	492 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	LHX2	P50458	406 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DLX5	P56178	289 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PRR5	P85299	388 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TLE4	Q04727	773 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	HSPB3	Q12988	150 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	RCAN2	Q14206	197 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TOMM20	Q15388	145 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GALNTL6	Q49A17	601 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CES4A	Q5XG92	561 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	AAGAB	Q6PD74	315 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	IFNE	Q86WN2	208 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	WNT2B	Q93097	391 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SH3GL2	Q99962	352 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	JKAMP	Q9P055	326 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	HAO1	Q9UJM8	370 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		10.42	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ABCA4	P78363	2273 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ALG1L2	C9J202	215 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	KCNH1	O95259	989 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	HSPA4L	O95757	839 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	IGKV1D-16	P01601	117 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SERPINE1	P05121	402 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DPP4	P27487	766 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GPC1	P35052	558 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	OPRM1	P35372	400 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	HPCAL1	P37235	193 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ASCL1	P50553	236 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZNF136	P52737	540 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DIO3	P55073	304 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CLDN18	P56856	261 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	OCRL	Q01968	901 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	EMX2	Q04743	252 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MPP2	Q14168	576 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MED12L	Q86YW9	2145 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	NUP43	Q8NFH3	380 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	OR2M3	Q8NG83	312 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TM9SF2	Q99805	663 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	MPDZ	O75970	2070 aa		10.41	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FAM221A	A4D161	298 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	HCRTR2	O43614	444 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ITM2A	O43736	263 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	RCBTB2	O95199	551 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ZWINT	O95229	277 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	UTS2	O95399	124 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ACP2	P11117	423 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	LAMP1	P11279	417 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PEPD	P12955	493 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	TBXA2R	P21731	343 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CTSS	P25774	331 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PCYT1A	P49585	367 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CLDN8	P56748	225 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	PTGR1	Q14914	329 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	CPTP	Q5TA50	214 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	IL23R	Q5VWK5	629 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	ARSK	Q6UWY0	536 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	APOOL	Q6UXV4	268 aa		10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
CS-223	ENST00000551137	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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