RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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PTPRB-209ENST00000550857 ZNF264O43296 627 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-209ENST00000550857 PLGLAQ15195 96 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRB-209ENST00000550857 SH3GL2Q99962 352 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.57□□□□□ -1.2
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