RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 FOXL2P58012 376 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 MLF1P58340 268 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 BNIP2Q12982 314 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 MFAP5Q13361 173 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 RGNQ15493 299 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 EIPR1Q53HC9 387 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 DCST2Q5T1A1 773 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 REEP3Q6NUK4 255 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 PACS2Q86VP3 889 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 IFNEQ86WN2 208 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 MISPQ8IVT2 679 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 C9orf40Q8IXQ3 194 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 ZNF614Q8N883 585 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 HIPK4Q8NE63 616 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 OR2T12Q8NG77 320 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 BBS10Q8TAM1 723 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 CPT1CQ8TCG5 803 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 DOK4Q8TEW6 326 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 OMA1Q96E52 524 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 VSTM2LQ96N03 204 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 RNF32Q9H0A6 362 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 MUC13Q9H3R2 512 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 NANOGQ9H9S0 305 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 SERHLQ9NQF3 203 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 LRFN1Q9P244 771 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 STOML1Q9UBI4 398 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 ABCG2Q9UNQ0 655 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 IFT52Q9Y366 437 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 WDR45Q9Y484 360 aa8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.89□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 A0A0G2JPF8 293 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 ELOVL7A1L3X0 281 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 OR5H15A6NDH6 313 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 K7EM74 188 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 ACOT7O00154 380 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 PPM1BO75688 479 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 SNX4O95219 450 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 PRF1P14222 555 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 IL7RP16871 459 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 ABCD3P28288 659 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 PTGER1P34995 402 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 CDKN2CP42773 168 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 SLC7A2P52569 658 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 MTPNP58546 118 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 NCALDP61601 193 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 KCNJ2P63252 427 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 PHC1P78364 1004 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 CDK6Q00534 326 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 MGAT2Q10469 447 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 SNTA1Q13424 505 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 GAB1Q13480 694 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 RAPSNQ13702 412 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 SCARB2Q14108 478 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 NNATQ16517 81 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 SLC22A10Q63ZE4 541 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 TREML1Q86YW5 311 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 OR10A6Q8NH74 314 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 FBXO30Q8TB52 745 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 PRR7Q8TB68 274 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 DIO2Q92813 273 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 CDS1Q92903 461 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 TMBIM1Q969X1 311 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 MARVELD3Q96A59 401 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 RNF145Q96MT1 663 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-218ENST00000550159 RASL10BQ96S79 203 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms