RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545097.1

CCR3-208, Transcript of C-C motif chemokine receptor 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR3, Length 1,786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCR3-208	ENST00000545097	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	SZRD1	Q7Z422	152 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	GATS	Q8NAP1	163 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	OR4C3	Q8NH37	302 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	CDS1	Q92903	461 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	ERP27	Q96DN0	273 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	INPP5K	Q9BT40	448 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	CBLC	Q9ULV8	474 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	RNF6	Q9Y252	685 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097		A0A0G2JNJ9	132 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097		A0A1W2PRB8	838 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	ACOT7	O00154	380 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	TP53I11	O14683	189 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	ZIC3	O60481	467 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	TRAPPC6A	O75865	159 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	UTS2	O95399	124 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	IL33	O95760	270 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	PRPS2	P11908	318 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	NAGA	P17050	411 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	GRK2	P25098	689 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	ASMT	P46597	345 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	MASP1	P48740	699 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	SLC18A1	P54219	525 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	CLDN15	P56746	228 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	NRG3	P56975	720 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	C21orf58	P58505	322 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	DCAF7	P61962	342 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	PLAUR	Q03405	335 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	RBPJ	Q06330	500 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	PMPCA	Q10713	525 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	FUT5	Q11128	374 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	CD226	Q15762	336 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	PGS1	Q32NB8	556 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	CPTP	Q5TA50	214 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	FADS6	Q8N9I5	356 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	OR2M3	Q8NG83	312 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	FAM110B	Q8TC76	370 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	SLC9A6	Q92581	669 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	TIMP4	Q99727	224 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	EBF4	Q9BQW3	602 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	DUSP26	Q9BV47	211 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	AIG1	Q9NVV5	245 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	GIN1	Q9NXP7	522 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	MED11	Q9P086	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097		Q9UFV3	132 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	CFL2	Q9Y281	166 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	SPG11	Q96JI7	2443 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	PRSS44	E7EML9	344 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097		E9PLN8	166 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	PRRG2	O14669	202 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	EMC8	O43402	210 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	COQ9	O75208	318 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	KCNK2	O95069	426 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	IL12B	P29460	328 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	PNLIPRP2	P54317	469 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	GFRA1	P56159	465 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	TFF3	Q07654	80 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	MLC1	Q15049	377 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	GTDC1	Q4AE62	458 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CCR3-208	ENST00000545097	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23

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