RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	UCK2	Q9BZX2	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CFL2	Q9Y281	166 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A1W2PS29	197 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	HELT	A6NFD8	242 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636		M0QYT0	321 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RAD51C	O43502	376 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT36	O76013	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CDK14	O94921	469 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CAPN1	P07384	714 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ELANE	P08246	267 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CTSE	P14091	401 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CASP4	P49662	377 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	DNA2	P51530	1060 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	NDST1	P52848	882 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP12A	P54707	1039 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	DLX5	P56178	289 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	HSD11B2	P80365	405 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CAV1	Q03135	178 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RUNX2	Q13950	521 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PDK4	Q16654	411 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT39	Q6A163	491 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	P3H4	Q92791	437 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CITED1	Q99966	193 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PKIB	Q9C010	78 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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