RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519885.5

TRAPPC2-208, Transcript of trafficking protein particle complex 2, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC2, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2-208ENST00000519885 ABCD2Q9UBJ2 740 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 PADI2Q9Y2J8 665 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 MMACHCQ9Y4U1 282 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 RNF215Q9Y6U7 377 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 A0A1B0GX78 115 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 LNP1A1A4G5 178 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 PRORSD1PA6NEY8 169 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 A8MVJ9 347 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 FAM220BPB1ANY3 271 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 C9J4A7 227 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 D6RAR5 112 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC2-208ENST00000519885 ANKRD28O15084 1053 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 NKX2-8O15522 239 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 SDC3O75056 442 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 SERPIND1P05546 499 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 GPIP06744 558 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 KLK1P06870 262 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 FHP07954 510 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC2-208ENST00000519885 HSD17B1P14061 328 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 IL1RNP18510 177 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 UQCRC2P22695 453 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC2-208ENST00000519885 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 HTR1EP28566 365 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 LCN1P31025 176 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 IFNA8P32881 189 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 NBL1P41271 181 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 FRKP42685 505 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 HTR6P50406 440 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 HSD17B7P56937 341 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 RAB38P57729 211 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 TAS2R50P59544 299 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 NCALDP61601 193 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 CYP4F2P78329 520 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 HPCAP84074 193 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 ABHD18Q0P651 414 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 RIPK1Q13546 671 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC2-208ENST00000519885 PTGR1Q14914 329 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC2-208ENST00000519885 CCDC6Q16204 474 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 CYP51A1Q16850 503 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 HKDC1Q2TB90 917 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 FAM71E1Q6IPT2 247 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC2-208ENST00000519885 AAGABQ6PD74 315 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC2-208ENST00000519885 DEFB119Q8N690 84 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRAPPC2-208ENST00000519885 OR2T11Q8NH01 316 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 PSMA8Q8TAA3 256 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 C16orf78Q8WTQ4 265 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 NAT14Q8WUY8 206 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 OR5P2Q8WZ92 322 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 NR4A3Q92570 626 aa4.59□□□□□ -1.67
TRAPPC2-208ENST00000519885 LRRC58Q96CX6 371 aa4.59□□□□□ -1.67
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