RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519404.5

CNOT8-210, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNOT8, Length 945 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-210ENST00000519404 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 A0A1W2PQD3 144 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ALG1L2C9J202 215 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 SLC28A2O43868 658 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 STX11O75558 287 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 UTS2O95399 124 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 OR12D1P0DN82 309 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 EDN3P14138 238 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 DNASE1L1P49184 302 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 GAS1P54826 345 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 MLLT10P55197 1068 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 RGNQ15493 299 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ZNF605Q86T29 641 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 SIAH3Q8IW03 269 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ZNF597Q96LX8 424 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 KLRF1Q9NZS2 232 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 VAPAQ9P0L0 249 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 B4GALT7Q9UBV7 327 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 A0A0G2JMM0 328 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 A0A1W2PPB8 328 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 A0A1W2PRS3 328 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 PINLYPA6NC86 204 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 KIR3DP1A8MWS1 328 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 NPIPB9F8W1W9 429 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 FBP2O00757 339 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 SNPHO15079 494 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 DCTN3O75935 186 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 UNC5CO95185 931 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 GPX2P18283 190 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 PRDX6P30041 224 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 TDGF1P3P51864 188 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ATP12AP54707 1039 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 GNA13Q14344 377 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 GTDC1Q4AE62 458 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 COLEC12Q5KU26 742 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 DESI1Q6ICB0 168 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 MISPQ8IVT2 679 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ZNF527Q8NB42 609 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 XAGE5Q8WWM1 108 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ROPN1LQ96C74 230 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 CGREF1Q99674 301 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 ARMCX1Q9P291 453 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT8-210ENST00000519404 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 EVPLLA8MZ36 301 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 G3V3Y1 287 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 ADAM10O14672 748 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 CBR3O75828 277 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 CRATP43155 626 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 RFX3P48380 749 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 FOXK1P85037 733 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 PMP22Q01453 160 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 PLGLB1Q02325 96 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 NFYCQ13952 458 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 MMEL1Q495T6 779 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 COX20Q5RI15 118 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 CCNJQ5T5M9 372 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 BICRALQ6AI39 1079 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT8-210ENST00000519404 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms