RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	OR2M5	A3KFT3	312 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110		H3BML4	177 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	SEC14L5	O43304	696 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	TNFRSF21	O75509	655 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	IGKV1D-16	P01601	117 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	PROC	P04070	461 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	MYL2	P10916	166 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	NTS	P30990	170 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	CCKAR	P32238	428 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	CD79B	P40259	229 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	RFX3	P48380	749 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	CLDN20	P56880	219 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	SIRPA	P78324	504 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	IMPG1	Q17R60	797 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	OR2A2	Q6IF42	318 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	APOOL	Q6UXV4	268 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	IFT20	Q8IY31	132 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	ELP4	Q96EB1	424 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	EGLN2	Q96KS0	407 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110		Q9N2J8	555 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		11	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	GMFG	O60234	142 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	GLRA3	O75311	464 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	UTS2	O95399	124 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	CGA	P01215	116 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	GABRA3	P34903	492 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	UGT2B10	P36537	528 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	PCYT1A	P49585	367 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	KIAA0040	Q15053	153 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	PON3	Q15166	354 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	BIVM	Q86UB2	503 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	PIK3R3	Q92569	461 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	CCDC126	Q96EE4	140 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	RNF122	Q9H9V4	155 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF175	Q9Y473	711 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	LINC01387	J3KSC0	135 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	EMC8	O43402	210 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	PLIN3	O60664	434 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	SEC22B	O75396	215 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	CRCP	O75575	148 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	ANGPTL1	O95841	491 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	UROS	P10746	265 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	POU2F1	P14859	743 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	CRYGS	P22914	178 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	HSPB3	Q12988	150 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	GUSBP1	Q15486	140 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF385B	Q569K4	471 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF550	Q7Z398	422 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	GALNT10	Q86SR1	603 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	MARK4	Q96L34	752 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	MED18	Q9BUE0	208 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SNHG4-208	ENST00000514110	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		10.98	□□□□□ -0.65

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