RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ELP4Q96EB1 424 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 FAM111AQ96PZ2 611 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PINK1Q9BXM7 581 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PTGES2Q9H7Z7 377 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 KLHL28Q9NXS3 571 aa15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 OR2M5A3KFT3 312 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 H3BML4 177 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 GLRA3O75311 464 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 TNFRSF21O75509 655 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CRCPO75575 148 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CD79BP40259 229 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CLK3P49761 638 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CLDN20P56880 219 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 SIRPAP78324 504 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
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HERC3-211ENST00000513325 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 NOXRED1Q6NXP6 359 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 FAM76AQ8TAV0 307 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 EGLN2Q96KS0 407 aa15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
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HERC3-211ENST00000513325 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 GXYLT2A0PJZ3 443 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 DEFB108AA8MXU0 73 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 LINC01387J3KSC0 135 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 SIAH2O43255 324 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 EMC8O43402 210 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PROCP04070 461 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 GABRA3P34903 492 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PCYT1AP49585 367 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 NAA20P61599 178 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PON3Q15166 354 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 FRMD7Q6ZUT3 714 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 SH2D5Q6ZV89 423 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 FNDC9Q8TBE3 224 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 SMR3AQ99954 134 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PIGQQ9BRB3 760 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 RNF122Q9H9V4 155 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 ZNF175Q9Y473 711 aa15.24■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 H3BQF6 201 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 GMFGO60234 142 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 SEC22BO75396 215 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 UTS2O95399 124 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 ANGPTL1O95841 491 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CGAP01215 116 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 IGKV1D-16P01601 117 aa15.23■□□□□ 0.03
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HERC3-211ENST00000513325 UGT2B10P36537 528 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 C17orf67Q0P5P2 114 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0040Q15053 153 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 GRAMD1BQ3KR37 738 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CFAP157Q5JU67 520 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 APOOLQ6UXV4 268 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 IKBIPQ70UQ0 350 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 Q71RC1 249 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 BIVMQ86UB2 503 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 EXOC3L1Q86VI1 746 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CEP112Q8N8E3 955 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PIK3R3Q92569 461 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 C18orf12Q96KH6 178 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 RHOXF2Q9BQY4 288 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 SLC39A3Q9BRY0 314 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 MED18Q9BUE0 208 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 C3orf14Q9HBI5 128 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 EQTNQ9NQ60 294 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 ELOVL5Q9NYP7 299 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 ZNF226Q9NYT6 803 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CCL27Q9Y4X3 112 aa15.23■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 SHISA8B8ZZ34 492 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PLIN3O60664 434 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 KCNH1O95259 989 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 UROSP10746 265 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CCKARP32238 428 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 KCNJ5P48544 419 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 DNAJB13P59910 316 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 PRR5P85299 388 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 HSPB3Q12988 150 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 SGCBQ16585 318 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CCDC153Q494R4 210 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 SHEQ5VZ18 495 aa15.22■□□□□ 0.03
HERC3-211ENST00000513325 CLEC6AQ6EIG7 209 aa15.22■□□□□ 0.03
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