RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MTERF3	Q96E29	417 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	C1orf50	Q9BV19	199 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SERHL	Q9NQF3	203 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PNPO	Q9NVS9	261 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464		H0Y3Z8	333 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	KLF11	O14901	512 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PDPK1	O15530	556 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MAPK1	P28482	360 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	EVI2B	P34910	448 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MC3R	P41968	323 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	KIR2DL3	P43628	341 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ASMT	P46597	345 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GFRA1	P56159	465 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SORD	Q00796	357 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PSG6	Q00889	435 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GAB1	Q13480	694 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PTGR1	Q14914	329 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF385B	Q569K4	471 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ATG16L1	Q676U5	607 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM107	Q6UX40	140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	NATD1	Q8N6N6	113 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM222B	Q8WU58	562 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	WNT2B	Q93097	391 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ELP4	Q96EB1	424 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TRIB1	Q96RU8	372 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	NUF2	Q9BZD4	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	REEP4	Q9H6H4	257 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ASIC5	Q9NY37	505 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DKKL1	Q9UK85	242 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CBLC	Q9ULV8	474 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TACC2	O95359	2948 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	UPK1A	O00322	258 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	AKAP10	O43572	662 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	RCBTB2	O95199	551 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNH1	O95259	989 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	IL33	O95760	270 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PRPS2	P11908	318 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PEPD	P12955	493 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DPP4	P27487	766 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	LCN1	P31025	176 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	UQCRC1	P31930	480 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GPC1	P35052	558 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF136	P52737	540 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DLX5	P56178	289 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	EMX2	Q04743	252 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SMU1	Q2TAY7	513 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	IL23R	Q5VWK5	629 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	NINJ1	Q92982	152 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PPCDC	Q96CD2	204 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SFXN2	Q96NB2	322 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PIGM	Q9H3S5	423 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	STOML1	Q9UBI4	398 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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