RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	CPM	P14384	443 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP3CB	P16298	524 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	STMN1	P16949	149 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGDS	P41222	190 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ARFIP1	P53367	373 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL4C	P56559	192 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGCS1	Q01581	520 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	RAET1L	Q5VY80	246 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	STEAP4	Q687X5	459 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX9	Q8N6V9	391 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC39	Q96DD0	335 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	MARK4	Q96L34	752 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PINK1	Q9BXM7	581 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ALG9	Q9H6U8	611 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	HEY2	Q9UBP5	337 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	9.74	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CLOCK	O15516	846 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PLAU	P00749	431 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	IL12B	P29460	328 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	BSG	P35613	385 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SLMAP	Q14BN4	828 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	MORF4L2	Q15014	288 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL2A1	Q16548	175 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SGCB	Q16585	318 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	VHLL	Q6RSH7	139 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	RAPH1	Q70E73	1250 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKL2	Q92772	493 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TMBIM1	Q969X1	311 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	COL21A1	Q96P44	957 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PRODH2	Q9UF12	536 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		9.73	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	NOTO	A8MTQ0	251 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BML4	177 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	UBXN8	O00124	270 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF4	O43474	513 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PIAS1	O75925	651 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX30	O94993	753 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM157C	P0CG43	387 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FCGR2A	P12318	317 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	HK1	P19367	917 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	GRK2	P25098	689 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ACVR1B	P36896	505 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKN1A	P38936	164 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CTBP2	P56545	445 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CUL3	Q13618	768 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	EFR3A	Q14156	821 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	E2F2	Q14209	437 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PON3	Q15166	354 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	LIPJ	Q5W064	366 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ADO	Q96SZ5	270 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	PLLP	Q9Y342	182 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ROS1	P08922	2347 aa		9.72	□□□□□ -0.85
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		9.71	□□□□□ -0.86
SKAP2-209	ENST00000497511	FRG2C	A6NGY1	282 aa		9.71	□□□□□ -0.86

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms