RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	SETD9	Q8NE22	299 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	TANK	Q92844	425 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	GIMAP5	Q96F15	307 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	OR7D2	Q96RA2	312 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	BTBD2	Q9BX70	525 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	KCND3	Q9UK17	655 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	FOXS1	O43638	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	CHRM4	P08173	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	IFI6	P09912	130 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ANXA8	P13928	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	TMPRSS3	P57727	454 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	CD47	Q08722	323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	FUT5	Q11128	374 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	MICA	Q29983	383 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	BORA	Q6PGQ7	559 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	COX15	Q7KZN9	410 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	OR7G2	Q8NG99	324 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ACER3	Q9NUN7	267 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	CTSF	Q9UBX1	484 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508		E9PQ18	207 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508		J3KTA2	159 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	NKX2-8	O15522	239 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	SLITRK5	O94991	958 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR75	O95800	540 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	AGR2	O95994	175 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ELK4	P28324	431 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ISL1	P61371	349 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	SKP1	P63208	163 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	IL1RL1	Q01638	556 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	NCF4	Q15080	339 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	SYT16	Q17RD7	645 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	CDC73	Q6P1J9	531 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	OR2L13	Q8N349	312 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	COL26A1	Q96A83	441 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	PITX2	Q99697	317 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	GIN1	Q9NXP7	522 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMEM18-208	ENST00000497508	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	DUXA	A6NLW8	204 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	C21orf140	B9A014	251 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508		C9J4A7	227 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	SGK494	L7N484	410 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	GADD45G	O95257	159 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	EMP3	P54852	163 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	ERV3-1	Q14264	604 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	NDUFA9	Q16795	377 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	GPAT3	Q53EU6	434 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC5A8	Q8N695	610 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	FEV	Q99581	238 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	APOL4	Q9BPW4	351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	EQTN	Q9NQ60	294 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMEM18-208	ENST00000497508	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24

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