RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 MBTPS2O43462 519 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DPM1O60762 260 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 AKR1C3P42330 323 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 H2BFSP57053 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 BCL2L1Q07817 233 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NAE1Q13564 534 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTMR1Q13613 665 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 VMACQ2NL98 169 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADGRF1Q5T601 910 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR5T3Q8NGG3 340 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR5J2Q8NH18 312 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HMGB4Q8WW32 186 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TEAD3Q99594 435 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR20Q99678 358 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DPY30Q9C005 99 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLMPQ9H6B4 373 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GBF1Q92538 1859 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 A0A1B0GW55 424 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOX15O60248 233 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FMO6PO60774 539 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1SP09871 688 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANXA8P13928 327 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FDXRP22570 491 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SFNP31947 248 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRATP43155 626 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 JAG1P78504 1218 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OAFQ86UD1 273 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR2L5Q8NG80 312 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CASD1Q96PB1 797 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 F2RL3Q96RI0 385 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUX4Q9UBX2 424 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANK1P16157 1881 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NINQ8N4C6 2090 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 J3KTA2 159 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB4AP20338 218 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 AQP1P29972 269 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 AVPR2P30518 371 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GABRA5P31644 462 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCR9P51686 369 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDK6Q00534 326 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEMG2Q02383 582 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HGFACQ04756 655 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TPBGQ13641 420 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 AFMIDQ63HM1 303 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 STK40Q8N2I9 435 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF75AQ96N20 296 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMED9Q9BVK6 235 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHRDQ9H2X0 955 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.47□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OPN4Q9UHM6 478 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms