RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 EDARQ9UNE0 448 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 VDAC3Q9Y277 283 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 WDR91A4D1P6 747 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 H0YC42 278 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 H3BQF6 201 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PEX11AO75192 247 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 UTS2O95399 124 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NUDT14O95848 222 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TGM6O95932 706 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CHRNGP07510 517 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NEFHP12036 1026 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CPN1P15169 458 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CD1EP15812 388 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ALDH3A1P30838 453 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PEX19P40855 299 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 LHX2P50458 406 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 DIO3P55073 304 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJB13P59910 316 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NAA20P61599 178 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PSG6Q00889 435 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 KEAP1Q14145 624 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PCLAFQ15004 111 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GRAMD1BQ3KR37 738 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 VPS26BQ4G0F5 336 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF614Q8N883 585 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 COX18Q8N8Q8 333 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ACBD4Q8NC06 268 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 NUP43Q8NFH3 380 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 OR2M3Q8NG83 312 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TWIST2Q8WVJ9 160 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 APOPT1Q96IL0 206 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R36Q96LQ0 422 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SH3GL2Q99962 352 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 REEP4Q9H6H4 257 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 RASSF1Q9NS23 344 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GALNT8Q9NY28 637 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 A0A087WV62 115 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PIP5K1BO14986 540 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZIC3O60481 467 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 RCBTB2O95199 551 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 IL33O95760 270 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ANGPTL1O95841 491 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ALOX5P09917 674 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 EPXP11678 715 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PEPDP12955 493 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF708P17019 499 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SDC1P18827 310 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 SOAT1P35610 550 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 HPCAL1P37235 193 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 GFRA1P56159 465 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CLDN15P56746 228 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CLDN18P56856 261 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TP53BP2Q13625 1128 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PON3Q15166 354 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PGS1Q32NB8 556 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF385BQ569K4 471 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CCNJQ5T5M9 372 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 IKBIPQ70UQ0 350 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 OR2L13Q8N349 312 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 OR2T11Q8NH01 316 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 FIG4Q92562 907 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 WNT2BQ93097 391 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 PGM2Q96G03 612 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 C16orf58Q96GQ5 468 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms