RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 GNG11P61952 73 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 IFT88Q13099 833 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PON3Q15166 354 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 TECRLQ5HYJ1 363 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 SCIMPQ6UWF3 145 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PAGE2Q7Z2X7 111 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC25Q86WR0 208 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PHC2Q8IXK0 858 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 OR7G2Q8NG99 324 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 OR4K17Q8NGC6 315 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL29Q96CT2 875 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 BTBD9Q96Q07 612 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 HBEGFQ99075 208 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 NPAS1Q99742 590 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 VPS11Q9H270 941 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 FOLH1BQ9HBA9 442 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 RNF14Q9UBS8 474 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PCTPQ9UKL6 214 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PSME2Q9UL46 239 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PROCRQ9UNN8 238 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 JMJD1CQ15652 2540 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 CUBNO60494 3623 aa7.57□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 RNF212BA8MTL3 300 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 H3BML4 177 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 GUCY1B2O75343 617 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 NTN1O95631 604 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 OPN1LWP04000 364 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 IL3P08700 152 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 SBK3P0C264 359 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 TYK2P29597 1187 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PAFAH1B1P43034 410 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PSG6Q00889 435 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 CALCOCO2Q13137 446 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 EFR3AQ14156 821 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 BEX5Q5H9J7 111 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 RAET1LQ5VY80 246 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 APOOLQ6UXV4 268 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 MARCH3Q86UD3 253 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF611Q8N823 705 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF675Q8TD23 568 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 SELENOMQ8WWX9 145 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 NEUROG1Q92886 237 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 REG4Q9BYZ8 158 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF175Q9Y473 711 aa7.56□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 MED12LQ86YW9 2145 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 RTTNQ86VV8 2226 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 OVOL3O00110 214 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 STX16O14662 325 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 HS3ST1O14792 307 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 GMFGO60234 142 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 NDUFS7O75251 213 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 OR4F21O95013 312 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 ESRRBO95718 433 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 IL12BP29460 328 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 STX2P32856 288 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 EVI2BP34910 448 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 KRT20P35900 424 aa7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CTPS1-208ENST00000479480 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms