RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMCO6	Q96DC7	493 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DPY30	Q9C005	99 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		10.12	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRSS44	E7EML9	344 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959		E9PBE3	544 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	BCKDK	O14874	412 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNK2	O95069	426 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	BMP7	P18075	431 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCT	P40126	519 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIR3DL1	P43629	444 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DGKQ	P52824	942 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP2R2A	P63151	447 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRR5	P85299	388 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	TOMM20	Q15388	145 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDC73	Q6P1J9	531 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAOX	Q6QHF9	649 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPTN	Q6XPR3	784 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	MARCH3	Q86UD3	253 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	COX18	Q8N8Q8	333 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	FADS6	Q8N9I5	356 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	GATS	Q8NAP1	163 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SFXN5	Q8TD22	340 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	TESC	Q96BS2	214 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	C7orf26	Q96N11	449 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPAS1	Q99742	590 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	EBF4	Q9BQW3	602 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF6	Q9Y252	685 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CFLAR	O15519	480 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OIP5	O43482	229 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	GMFG	O60234	142 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	TOX	O94900	526 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNH1	O95259	989 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALOX5	P09917	674 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACVR2A	P27037	513 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADH7	P40394	386 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDKN2C	P42773	168 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRIM2	P49643	509 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSPH	P78330	225 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	FUT5	Q11128	374 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD226	Q15762	336 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	NXN	Q6DKJ4	435 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	VASN	Q6EMK4	673 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTFR2	Q6P444	385 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAXE	Q8NCW5	288 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR2M3	Q8NG83	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR4C3	Q8NH37	302 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM110B	Q8TC76	370 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SARAF	Q96BY9	339 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR7D2	Q96RA2	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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