RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469534.1

ITGA6-208, Transcript of integrin subunit alpha 6, human

TSL 2

Gene ITGA6, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA6-208	ENST00000469534	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF675	Q8TD23	568 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF721	Q8TF20	911 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	STMN2	Q93045	179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	RELT	Q969Z4	430 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	TAMM41	Q96BW9	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	COL21A1	Q96P44	957 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	FRYL	O94915	3013 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ITGA6-208	ENST00000469534	FREM3	P0C091	2139 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	BLACE	A4D250	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534		M0R3H8	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	PLOD2	O00469	737 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	PEX12	O00623	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	SOCS6	O14544	535 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	PLOD3	O60568	738 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	REM1	O75628	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	CYP7B1	O75881	506 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	KCNK2	O95069	426 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	PGM3	O95394	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	NTN1	O95631	604 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	COX6A1	P12074	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	LIF	P15018	202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	IL10	P22301	178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	KDELR2	P33947	212 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	CD96	P40200	585 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	STAT5A	P42229	794 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	CRYBA2	P53672	197 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	SLC37A1	P57057	533 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	SLC26A5	P58743	744 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	ACTR3	P61158	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	HPCA	P84074	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	PSG6	Q00889	435 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	FUT7	Q11130	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	FADD	Q13158	208 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	TMEM205	Q6UW68	189 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ITGA6-208	ENST00000469534	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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