RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SPTB	P11277	2137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080		A0A087X002	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080		A0A0D9SEW6	157 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080		A4D1N5	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	GBA	P04062	536 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	P4HA1	P13674	534 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CA4	P22748	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PSMA3	P25788	255 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CD82	P27701	267 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SLC6A6	P31641	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	WNT5A	P41221	380 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PRKCI	P41743	596 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	IRF4	Q15306	451 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	AZIN2	Q96A70	460 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ASCL2	Q99929	193 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080		A0A1W2PN81	502 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080		O00370	1275 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	KLRC4	O43908	158 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	WDPCP	O95876	746 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CD160	O95971	181 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	TCN2	P20062	427 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CD1C	P29017	333 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CHRNA7	P36544	502 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	VEGFC	P49767	419 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CDR2	Q01850	454 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM187	Q14656	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	FCN2	Q15485	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	TAF4B	Q92750	862 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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