RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 TEX35Q5T0J7 233 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 METTL25Q8N6Q8 603 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 OR7G2Q8NG99 324 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 OR6K3Q8NGY3 331 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ERP27Q96DN0 273 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ACTR6Q9GZN1 396 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 C12orf49Q9H741 205 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ABCG2Q9UNQ0 655 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 VDAC3Q9Y277 283 aa9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CUBNO60494 3623 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ESYT3A0FGR9 886 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 LINC01387J3KSC0 135 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 MANBAO00462 879 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 SYNGR4O95473 234 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 KRT6AP02538 564 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 KRT6BP04259 564 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CHN1P15882 459 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 SLC6A8P48029 635 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 KRT6CP48668 564 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 OCRLQ01968 901 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ACSM2AQ08AH3 577 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 HEPACAMQ14CZ8 416 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TRADDQ15628 312 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ACSM2BQ68CK6 577 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM107Q6UX40 140 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 MARCH3Q86UD3 253 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 STK32CQ86UX6 486 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF611Q8N823 705 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 Q9N2J8 555 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 STOML1Q9UBI4 398 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 NFU1Q9UMS0 254 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.24□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CADP27708 2225 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 A8MT66 165 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 KLF4O43474 513 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 FADS1O60427 444 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 UTS2O95399 124 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 IFNA2P01563 188 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 OPN1LWP04000 364 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 HSD3B1P14060 373 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PAX1P15863 534 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 HSD3B2P26439 372 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 NTSP30990 170 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.934e-11■■■■■ 38.3
DDX39B-211ENST00000449757 MPIP34949 423 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CDKN1AP38936 164 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 FAPQ12884 760 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 RASA2Q15283 850 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 GUSBP1Q15486 140 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 SPIN4Q56A73 249 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 BEND4Q6ZU67 534 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF619Q8N2I2 560 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 OR10D3Q8NH80 312 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 RNF138Q8WVD3 245 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 SLC9A6Q92581 669 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 FBXW5Q969U6 566 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ACPTQ9BZG2 426 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 EQTNQ9NQ60 294 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
DDX39B-211ENST00000449757 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms