RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446903.5

TNS1-210, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS1, Length 2,464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-210ENST00000446903 ZNF285Q96NJ3 590 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CENPOQ9BU64 300 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CPNE5Q9HCH3 593 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 POLE4Q9NR33 117 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SPTBP11277 2137 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CHST10O43529 356 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 FRS3O43559 492 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 FOXS1O43638 330 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 AGR2O95994 175 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 OSMP13725 252 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 POU1F1P28069 291 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 PRKAR1BP31321 381 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 MAP3K8P41279 467 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 UGT2B15P54855 530 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 PRKCDQ05655 676 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CD300CQ08708 224 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 DEFB133Q30KQ1 61 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 PLAG1Q6DJT9 500 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CTHRC1Q96CG8 243 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 OR5M11Q96RB7 305 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SLC38A3Q99624 504 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 MGLLQ99685 303 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 FNDC11Q9BVV2 318 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 PRR14Q9BWN1 585 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 RNF167Q9H6Y7 350 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 UCKL1Q9NWZ5 548 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 K7ESF4 209 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 TBX1O43435 398 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 PIPP12273 146 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 NT5EP21589 574 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SLC15A1P46059 708 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 ILKQ13418 452 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 C19orf48Q6RUI8 117 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CLIP4Q8N3C7 705 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 OR52P1PQ8NH57 321 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 TCTN2Q96GX1 697 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SDF2Q99470 211 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 PIGUQ9H490 435 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 ADAP2Q9NPF8 381 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CTPS2Q9NRF8 586 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 TAS2R16Q9NYV7 291 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 NDOR1Q9UHB4 597 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 MKLN1Q9UL63 735 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 PEX16Q9Y5Y5 336 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 I3L1I5 382 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CCRL2O00421 344 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SDC3O75056 442 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SOX6P35712 828 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 GFERP55789 205 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 ZP2Q05996 745 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 ZER1Q7Z7L7 766 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 DIO2Q92813 273 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 INIPQ9NRY2 104 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 TMEM221A6NGB7 291 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 TGFBR3LH3BV60 316 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 FOSL2P15408 326 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 MMP11P24347 488 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SLC13A2Q13183 592 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 DUSP8Q13202 625 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 TSTQ16762 297 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CCNJQ5T5M9 372 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 STEAP3Q658P3 488 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CD300LDQ6UXZ3 194 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 OR4K5Q8NGD3 323 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 DNASE2BQ8WZ79 361 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 Q96MT0 163 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 GUCD1Q96NT3 240 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 GPA33Q99795 319 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 ZNF350Q9GZX5 532 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 WDR45Q9Y484 360 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 USP34Q70CQ2 3546 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 PIAS2O75928 621 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SOX14O95416 240 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 CBX7O95931 251 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 ADRA2AP08913 450 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SLC35E2P0CK97 266 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 DMWDQ09019 674 aa12.87□□□□□ -0.35
TNS1-210ENST00000446903 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms