RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	MISP	Q8IVT2	679 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PIK3R3	Q92569	461 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	RELT	Q969Z4	430 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	OR7D2	Q96RA2	312 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SERHL	Q9NQF3	203 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	EXD2	Q9NVH0	621 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TENM4	Q6N022	2769 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ALG1L2	C9J202	215 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	AQP7	O14520	342 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	UTS2	O95399	124 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	KRT75	O95678	551 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V1C1	P21283	382 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	GDF1	P27539	372 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PTPN6	P29350	595 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CA7	P43166	264 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	KHK	P50053	298 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	DCST2	Q5T1A1	773 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	MTFR2	Q6P444	385 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF527	Q8NB42	609 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CDS1	Q92903	461 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PRRG2	O14669	202 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	BCKDK	O14874	412 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV1D-16	P01601	117 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ABO	P16442	354 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PTGS2	P35354	604 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PER3	P56645	1201 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	DESI1	Q6ICB0	168 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	GTF2H4	Q92759	462 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PMM1	Q92871	262 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SARAF	Q96BY9	339 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SPDL1	Q96EA4	605 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	GNRHR2	Q96P88	292 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	GMEB1	Q9Y692	573 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	RELN	P78509	3460 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241		A0A096LPI6	279 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1B0GTH9	108 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241		C9JVG2	144 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	SCD	O00767	359 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ADAM10	O14672	748 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	STX11	O75558	287 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	ANP32D	O95626	131 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PTPA-222	ENST00000445241	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27

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