RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COL21A1Q96P44 957 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RASL10BQ96S79 203 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SDF2Q99470 211 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF350Q9GZX5 532 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HHATLQ9HCP6 504 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HPF1Q9NWY4 346 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD300AQ9UGN4 299 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPS6KA6Q9UK32 745 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFT52Q9Y366 437 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CACNA1AO00555 2505 aa9.47□□□□□ -0.89
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR6C70A6NIJ9 312 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H0YHG0 523 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H3BNH8 94 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 K7ENP7 123 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCDO00767 359 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDK2AP1O14519 115 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARPC2O15144 300 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIAA0513O60268 411 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PGM3O95394 542 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1QCP02747 245 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHRM4P08173 479 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GUSBP08236 651 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DCTP40126 519 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GZMMP51124 257 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCL11P51671 97 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PNLIPRP2P54317 469 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNJ2P63252 427 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q0VFX4 171 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR68Q15743 365 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADRM1Q16186 407 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LIN52Q52LA3 116 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EIPR1Q53HC9 387 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FCRLBQ6BAA4 426 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLYATQ6IB77 296 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H3F3CQ6NXT2 135 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BORAQ6PGQ7 559 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GALNT10Q86SR1 603 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARMC8Q8IUR7 673 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EID3Q8N140 333 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TM9SF4Q92544 642 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADOQ96SZ5 270 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STMN3Q9NZ72 180 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACTR3BQ9P1U1 418 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MKLN1Q9UL63 735 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A087WV48 116 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MASP2O00187 686 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SUV39H1O43463 412 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UTS2O95399 124 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF682O95780 498 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FBXO45P0C2W1 286 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NCK1P16333 377 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL7RP16871 459 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SOX3P41225 446 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYB561P49447 251 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SOX8P57073 446 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CXADRP78310 365 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FOXK2Q01167 660 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FUT5Q11128 374 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAPSNQ13702 412 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZSWIM7Q19AV6 140 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FRRS1Q6ZNA5 592 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPATA24Q86W54 205 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C10orf111Q8N326 155 aa9.45□□□□□ -0.9
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR5M3Q8NGP4 307 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms