RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 NME2P1O60361 137 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 WDR1O75083 606 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 AVILO75366 819 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 BANF1O75531 89 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PSMG1O95456 288 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PSG1P11464 419 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 RFC3P40938 356 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINB8P50452 374 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 EFNA3P52797 238 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 TAS2R50P59544 299 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 NAA20P61599 178 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 HERC3Q15034 1050 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 RAB6CQ53S08 254 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 TCTE1Q5JU00 501 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM220Q6QAJ8 160 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 RFX8Q6ZV50 586 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 COX15Q7KZN9 410 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CTAGE3PQ8IX95 158 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF567Q8N184 647 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 KIF2BQ8N4N8 673 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 SLC5A8Q8N695 610 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PPFIBP2Q8ND30 876 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 LPCAT1Q8NF37 534 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PEX13Q92968 403 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CERS2Q96G23 380 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 DACH2Q96NX9 599 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 FCRL5Q96RD9 977 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 RBBP8Q99708 897 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CCM2Q9BSQ5 444 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 C10orf88Q9H8K7 445 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 NDE1Q9NXR1 346 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 WWOXQ9NZC7 414 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 NDRG3Q9UGV2 375 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 BCAP29Q9UHQ4 241 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 STK38LQ9Y2H1 464 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 SEC16AO15027 2179 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD12Q6UB98 2062 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CUBNO60494 3623 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0J9YY10 115 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 OR2AG2A6NM03 316 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ISM1B1AKI9 464 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM233B4DJY2 109 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 H0YJX3 145 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 HCRTR1O43613 425 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 SLC4A1P02730 911 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 RALBP11234 206 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CPA3P15088 417 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PTPN3P26045 913 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CRABP2P29373 138 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 IDUAP35475 653 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CPOXP36551 454 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PGM1P36871 562 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 SLC1A6P48664 564 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CYB561P49447 251 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 AQP5P55064 265 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJB13P59910 316 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 SORDQ00796 357 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PLGLB1Q02325 96 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CDH17Q12864 832 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CTBP1Q13363 440 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 SQLEQ14534 574 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PRPSAP1Q14558 356 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 CHI3L2Q15782 390 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 ACSBG2Q5FVE4 666 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 LCE1EQ5T753 118 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 PRMT9Q6P2P2 845 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 EPGNQ6UW88 154 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-211ENST00000429595 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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