RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ST3GAL3Q11203 375 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 MAP4K2Q12851 820 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 TRAM2Q15035 370 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 TCTE1Q5JU00 501 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 TTLL10Q6ZVT0 673 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF595Q8IYB9 648 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 B3GNT7Q8NFL0 401 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 RAB2BQ8WUD1 216 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CNPPD1Q9BV87 410 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM150CB9EJG8 249 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CLDN4O14493 209 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ALAS2P22557 587 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CD1CP29017 333 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CSF2RBP32927 897 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 PSG6Q00889 435 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 GARNL3Q5VVW2 1013 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 SLX4IPQ5VYV7 408 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 YIPF2Q9BWQ6 316 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 EGLN3Q9H6Z9 239 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 NDOR1Q9UHB4 597 aa21.56■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.042e-8■■■■■ 37.4
FAAP20-209ENST00000428120 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0513O60268 411 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 OR2B3O76000 313 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ARL4DP49703 201 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 EMDP50402 254 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 BNC1Q01954 994 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 NNATQ16517 81 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 GDF7Q7Z4P5 450 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB46Q86UZ6 589 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 DGAT2Q96PD7 388 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 RAB33BQ9H082 229 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 FOLH1BQ9HBA9 442 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 KCNK2O95069 426 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 DBIP07108 87 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 OR1D4P47884 311 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 RGS19P49795 217 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF136P52737 540 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ST3GAL4Q11206 333 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 SHBQ15464 509 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CASP12Q6UXS9 341 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF614Q8N883 585 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM255BQ8WV15 326 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 MYDGFQ969H8 173 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 SLC41A3Q96GZ6 507 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 SAP130Q9H0E3 1048 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 FSCN3Q9NQT6 498 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 FKBP14Q9NWM8 211 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa21.55■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 C19orf67A6NJJ6 358 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 BRINP1O60477 761 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 COQ9O75208 318 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ENTPD6O75354 484 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 NKX2-2O95096 273 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 IFNA16P05015 189 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CDK1P06493 297 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 THBS1P07996 1170 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 NFATC3Q12968 1075 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 GRM7Q14831 915 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 RRM2BQ7LG56 351 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 KIF18BQ86Y91 864 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 LINC00471Q8N535 108 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 PHOX2BQ99453 314 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 DSN1Q9H410 356 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CLN6Q9NWW5 311 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 TAS2R16Q9NYV7 291 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 TVP23BQ9NYZ1 205 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 SLC7A7Q9UM01 511 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 AGRPO00253 132 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 DUX1O43812 170 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 NID1P14543 1247 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 GLB1P16278 677 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 IFNA8P32881 189 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 HSD11B2P80365 405 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 AQP6Q13520 282 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 EIPR1Q53HC9 387 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 LYSMD4Q5XG99 296 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 STX19Q8N4C7 294 aa21.54■■□□□ 1.04
FAAP20-209ENST00000428120 TCEANCQ8N8B7 351 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms