RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411083.1

RNU6-1135P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1135, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1135P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SDF4Q9BRK5 362 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DCTPP1Q9H773 170 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FANCFQ9NPI8 374 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR1A1Q9P1Q5 309 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TMEM5Q9Y2B1 443 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 L3MBTL1Q9Y468 752 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FAM149AA5PLN7 773 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ANGPTL7O43827 346 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MPZL1O95297 269 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GLULP15104 373 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SDC1P18827 310 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TGFBR1P36897 503 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 UBE2SQ16763 222 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C9orf152Q5JTZ5 239 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 WDR78Q5VTH9 848 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SAXO2Q658L1 398 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRR5LQ6MZQ0 368 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR52J3Q8NH60 311 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LHX4Q969G2 390 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C5orf30Q96GV9 206 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TIGD1Q96MW7 591 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KCNA7Q96RP8 456 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 S1PR3Q99500 378 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GPR61Q9BZJ8 451 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ANKRD2Q9GZV1 360 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SNX7Q9UNH6 387 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 USP6P35125 1406 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 E9PLD3 99 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ENTPD5O75356 428 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TNFSF13O75888 250 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KIAA0754O94854 1291 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CPNE6O95741 557 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EPOP01588 193 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FYNP06241 537 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RBMY1CP0DJD4 496 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CAPN3P20807 821 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ADORA2BP29275 332 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LIM2P55344 173 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GABPAQ06546 454 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC3A1Q07837 685 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BAMBIQ13145 260 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CUL4AQ13619 759 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KCNJ11Q14654 390 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ERMARDQ5T6L9 678 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CLEC4GQ6UXB4 293 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 UBALD2Q8IYN6 164 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CXorf58Q96LI9 332 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CPXM1Q96SM3 734 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NRIP2Q9BQI9 281 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LRRC2Q9BYS8 371 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ELOVL2Q9NXB9 296 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SPRR3Q9UBC9 169 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NRBP1Q9UHY1 535 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ILVBLA1L0T0 632 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C19orf81C9J6K1 198 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OVOL1O14753 267 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SELENOFO60613 162 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 POLR2MP0CAP2 368 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TPBGLP0DKB5 382 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 B4GALT1P15291 398 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CAPZA2P47755 286 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HAGHQ16775 308 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CFAP221Q4G0U5 840 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GPAT3Q53EU6 434 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ALFQ53S48 1182 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HCP5Q6MZN7 132 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ATRAIDQ6UW56 229 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR4L1Q8NH43 312 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR1E3Q8WZA6 343 aa-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms