RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D29Q9UFV1 150 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D3EA0A087X179 549 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D3LB9A6J9 549 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CDRT1O95170 752 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 APBB3O95704 486 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 EGFP01133 1207 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 STATHP02808 62 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D3HP0C7X1 549 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 GALP22466 123 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 DUSP8Q13202 625 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 DSG2Q14126 1118 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 XKRXQ6PP77 449 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 OR4E2Q8NGC2 313 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZFPM2Q8WW38 1151 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SLC9A6Q92581 669 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 MCHR1Q99705 422 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SRRQ9GZT4 340 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SURF4O15260 269 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 RGS5O15539 181 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 NFATC4Q14934 902 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FLYWCH1Q4VC44 716 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 GDPD1Q8N9F7 314 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SCAIQ8N9R8 606 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 GPR151Q8TDV0 419 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZG16BQ96DA0 208 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SACM1LQ9NTJ5 587 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D24Q9ULP9 559 aa22.2■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 DOCK9Q9BZ29 2069 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PS29 197 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 WWP2O00308 870 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF10CO14798 259 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CHST10O43529 356 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 MSL3P1P0C860 447 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 LIMS3P0CW19 117 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 LIMS4P0CW20 117 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CPN2P22792 545 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PDX1P52945 283 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 AGAP6Q5VW22 663 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 GDF7Q7Z4P5 450 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 KCT2Q8NC54 265 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 OR7G2Q8NG99 324 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 OR52N1Q8NH53 320 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TM9SF4Q92544 642 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SLC41A3Q96GZ6 507 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 AGAP4Q96P64 663 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SRMSQ9H3Y6 488 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 EQTNQ9NQ60 294 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ERVK13-1Q9NX77 482 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CDH10Q9Y6N8 788 aa22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PRR23AA6NEV1 266 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 IGHA1P01876 353 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CASP3P42574 277 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 NXNL2Q5VZ03 156 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZNF620Q6ZNG0 422 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 OR8H2Q8N162 312 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PSD4Q8NDX1 1056 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 RSC1A1Q92681 617 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 KAT2AQ92830 837 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 OR2A5Q96R48 311 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 LYRM4Q9HD34 91 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CTPS2Q9NRF8 586 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 SATB2Q9UPW6 733 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 WDR45Q9Y484 360 aa22.18■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 BTN3A3O00478 584 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PLD2O14939 933 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 HTR1FP30939 366 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PTGER1P34995 402 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 CDH11P55287 796 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 ZNF79Q15937 498 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 PGGHGQ32M88 737 aa22.17■■□□□ 1.14
PMS1-205ENST00000409985 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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