RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO34Q9NWN3 711 aa17.18■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 GMFGO60234 142 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 GFAPP14136 432 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ADH6P28332 368 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT6P53370 316 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM44Q2T9K0 475 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 FRG2Q64ET8 278 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 CYB5R2Q6BCY4 276 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 KCTD4Q8WVF5 259 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 CDKL2Q92772 493 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 FRG2BQ96QU4 278 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 GRIP2Q9C0E4 1043 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 NGBQ9NPG2 151 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 SYCE1LA8MT33 242 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 CXCL13O43927 109 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 LMX1BO60663 402 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 RAMP1O60894 148 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 OPN1LWP04000 364 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 IGHV4-31P0DP07 118 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 SRD5A1P18405 259 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 AGTR1P30556 359 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 NRF1Q16656 503 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ELOA3BQ3SY89 546 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 GALNT10Q86SR1 603 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 MARCH3Q86UD3 253 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 GABRG1Q8N1C3 465 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ELOA3Q8NG57 546 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 OR9A2Q8NGT5 310 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRG7Q96K78 797 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 HDHD5Q9BXW7 423 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM31Q9BZY9 425 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 PFDN4Q9NQP4 134 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 GLRX2Q9NS18 164 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 XPR1Q9UBH6 696 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 UTS2RQ9UKP6 389 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 OR10H1Q9Y4A9 318 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 FAM159BA6NKW6 160 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 FESP07332 822 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 TUBBP07437 444 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 IGFBP5P24593 272 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 SPRP35270 261 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 C21orf58P58505 322 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 PSG6Q00889 435 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 IRF9Q00978 393 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 SGO1Q5FBB7 561 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 SH2D4BQ5SQS7 431 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 SFRP5Q5T4F7 317 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 CLEC2AQ6UVW9 174 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 GAS2L3Q86XJ1 694 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL7Q8IXQ5 586 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 RHEBL1Q8TAI7 183 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 PYROXD1Q8WU10 500 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 HSD17B8Q92506 261 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 HTRA1Q92743 480 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6V1E2Q96A05 226 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 HBEGFQ99075 208 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 NPAS1Q99742 590 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 SLC12A4Q9UP95 1085 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXD12-201ENST00000404162 SHISA9B4DS77 424 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 SYNGR4O95473 234 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 IL32P24001 234 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PSPHP78330 225 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 GRTP1Q5TC63 336 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 FAM219BQ5XKK7 198 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CTAGE3PQ8IX95 158 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CACNG6Q9BXT2 260 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 MANSC1Q9H8J5 431 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 ABCG2Q9UNQ0 655 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 VDAC3Q9Y277 283 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 SNX8Q9Y5X2 465 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CADP27708 2225 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35F4A4IF30 521 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A16P16260 332 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CRABP2P29373 138 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 CCNG1P51959 295 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 DSCR9P59020 149 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 IFT88Q13099 833 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXD12-201ENST00000404162 TFAP2EQ6VUC0 442 aa17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms