RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf105B2RV13 164 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 OTX2P32243 289 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TLE3Q04726 772 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SYNPOQ8N3V7 929 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CENPBD1B2RD01 187 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 FTCDNL1E5RQL4 147 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PLATP00750 562 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 UBL4AP11441 157 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PITPNBP48739 271 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 DTX3Q8N9I9 347 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 OR51L1Q8NGJ5 315 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD8Q8NHS3 518 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC46Q96FV0 321 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 FN3KQ9H479 309 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 KNL1Q8NG31 2342 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM64A6NGJ6 449 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 H3BQ06 376 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 FUT1P19526 365 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 S100A2P29034 98 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF4P43489 277 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 BCL2L15Q5TBC7 163 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CYB561A3Q8NBI2 242 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 OR5AK2Q8NH90 309 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF442Q9H7R0 627 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 LHX3Q9UBR4 397 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 WDR37Q9Y2I8 494 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL8A6PVC2 850 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ACOT7O00154 380 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GPR39O43194 453 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf105O95561 183 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 LCKP06239 509 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CRABP1P29762 137 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 EMP2P54851 167 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL15Q96M94 604 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ADRA1AP35348 466 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GDPD1Q8N9F7 314 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SYT14Q8NB59 555 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PRRC1Q96M27 445 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 AGAP5A6NIR3 686 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 FNTBP49356 437 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PLAG1Q6DJT9 500 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MGAT4CQ9UBM8 478 aa19.13■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF850A8MQ14 1090 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PRKXP51817 358 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ATAD3CQ5T2N8 411 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD17BQ5VST6 288 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A10Q63ZE4 541 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MYH13Q9UKX3 1938 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 FOXK1P85037 733 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SPRED3Q2MJR0 410 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 FAM205BPQ63HN1 556 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 OR14L1PQ8NHC6 308 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ALG8Q9BVK2 526 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0895LQ68EN5 471 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 IL17RCQ8NAC3 791 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CLMPQ9H6B4 373 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 IRF4Q15306 451 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 HMBOX1Q6NT76 420 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 OR5D16Q8NGK9 328 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SCGB1C1Q8TD33 95 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 EGLN2Q96KS0 407 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 KCMF1Q9P0J7 381 aa19.12■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 MYH1P12882 1939 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 FRS3O43559 492 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 NARSO43776 548 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PTGS2P35354 604 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD11Q8NFV4 315 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM14Q96QK8 99 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 RNF215Q9Y6U7 377 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 BPNT1O95861 308 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 XCR1P46094 333 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF534Q76KX8 674 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TFAP2CQ92754 450 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2H4Q92759 462 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 UBXN10Q96LJ8 280 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 KCNS2Q9ULS6 477 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 HS3ST2Q9Y278 367 aa19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms