RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A087WXM4 84 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 H3BSH0 61 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 B4GAT1O43505 415 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 GDF9O60383 454 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 FMO6PO60774 539 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 PPM1BO75688 479 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 GPR4P46093 362 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 MLLT10P55197 1068 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 KCNJ10P78508 379 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 GPR78Q96P69 363 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 ITPAQ9BY32 194 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 SPNS1Q9H2V7 528 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 LYRM4Q9HD34 91 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 GALNT8Q9NY28 637 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 DAPL1A0PJW8 107 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 TBX1O43435 398 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 TSPAN12O95859 305 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 FURINP09958 794 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 FPR1P21462 350 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 PEX2P28328 305 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 RPS6KA3P51812 740 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 RIN1Q13671 783 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 PAQR7Q86WK9 346 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 LINC00471Q8N535 108 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 NAXEQ8NCW5 288 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 NT5DC2Q9H857 520 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 APMAPQ9HDC9 416 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 FAM60AQ9NP50 221 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 GPR83Q9NYM4 423 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 RTTNQ86VV8 2226 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 CYB5AP00167 134 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 FESP07332 822 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF806P0C7X5 589 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC6A8P48029 635 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 DNASE1L1P49184 302 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 SMSP52788 366 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 CXADRP78310 365 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 SIRPAP78324 504 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 CBFBQ13951 182 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 IHHQ14623 411 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 OR7A5Q15622 319 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 MMP21Q8N119 569 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC25A45Q8N413 288 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF559Q9BR84 538 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 DSN1Q9H410 356 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 CKLFQ9UBR5 152 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM3-201ENST00000361320 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 SERPINA3P01011 423 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 RHDQ02161 417 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 ISXQ2M1V0 245 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 KRT77Q7Z794 578 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 NRMQ8IXM6 262 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 FANK1Q8TC84 345 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 TSC22D3Q99576 134 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.59□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 CACNA1AO00555 2505 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 APOA1P02647 267 aa6.58□□□□□ -1.36
LRRTM3-201ENST00000361320 CD2P06729 351 aa6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms