RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 GRIN2CQ14957 1233 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TAZQ16635 292 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 FAM205BPQ63HN1 556 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJA3Q96EY1 480 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 GABRR3A8MPY1 467 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 E2F3O00716 465 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA1P01562 189 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CYCSP99999 105 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 HES5Q5TA89 166 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 NADSYN1Q6IA69 706 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF417Q8TAU3 575 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ARRDC2Q8TBH0 407 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 LPAR4Q99677 370 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF442Q9H7R0 627 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 MROH6A6NGR9 719 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 AKR1C4P17516 323 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 DRD5P21918 477 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CERS1P27544 350 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 LSSP48449 732 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 POU3F4P49335 361 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 FAM180BQ6P0A1 224 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PXKQ7Z7A4 578 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 OR51E2Q9H255 320 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SLA2Q9H6Q3 261 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 KCNS2Q9ULS6 477 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SYPP08247 313 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SLC26A5P58743 744 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TDGQ13569 410 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A13Q8TCU3 470 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 DDIT4LQ96D03 193 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 FN3KQ9H479 309 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 KRBA1A5PL33 1030 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM64A6NGJ6 449 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A8P48029 635 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SYT3Q9BQG1 590 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 RARRES3Q9UL19 164 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ICKQ9UPZ9 632 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 MYH7P12883 1935 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CRHBPP24387 322 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 S100PP25815 95 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA3P43357 314 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2H4Q92759 462 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 NELFAQ9H3P2 528 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 MYH3P11055 1940 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PPP6CO00743 305 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CRABP1P29762 137 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 MAP4K2Q12851 820 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 MORN1Q5T089 497 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF691Q5VV52 312 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM46Q7Z4K8 759 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 OR9A2Q8NGT5 310 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 OR5H2Q8NGV7 314 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 GPR148Q8TDV2 347 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PBDC1Q9BVG4 233 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF226Q9NYT6 803 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SFXN5Q8TD22 340 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CHPT1Q8WUD6 406 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 MYH7BA7E2Y1 1941 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SOX3P41225 446 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 WDR5P61964 334 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 EGFL6Q8IUX8 553 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 GPR137CQ8N3F9 429 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA4FO95754 770 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 EDN1P05305 212 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CDK2P24941 298 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 PBX2P40425 430 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF542PQ5EBM4 170 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 DESI1Q6ICB0 168 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 FRMPD2BQ6IN97 320 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 OR5D16Q8NGK9 328 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 NECTIN4Q96NY8 510 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 EVA1AQ9H8M9 152 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms