RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 ADRB3P13945 408 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 NTSP30990 170 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 IFNGR2P38484 337 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 OMPP47874 163 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 DHCR24Q15392 516 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF765Q7L2R6 523 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 LINC01555Q8NAE3 123 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 MGAT4AQ9UM21 535 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 A0A0G2JPF8 293 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CASC3O15234 703 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 PIP5K1CO60331 668 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ATP12AP54707 1039 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CSNK1G2P78368 415 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGAP19Q14CB8 494 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 TRAM2Q15035 370 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ZBTB37Q5TC79 503 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 SAMD12Q8N8I0 201 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 OR11H7Q8NGC8 314 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 RFKQ969G6 155 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 BTBD1Q9H0C5 482 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ENAMQ9NRM1 1142 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 SLC13A4Q9UKG4 626 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 IRAK3Q9Y616 596 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 LRIT2A6NDA9 550 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 DRD2P14416 443 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 OR10A3P58181 314 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ADAM29Q9UKF5 820 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 SLC19A2O60779 497 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 PLA1AQ53H76 456 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 GHDCQ8N2G8 530 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ING5Q8WYH8 240 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 RFT1Q96AA3 541 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CHFRQ96EP1 664 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 LGR4Q9BXB1 951 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 MARK1Q9P0L2 795 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CLEC4AQ9UMR7 237 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 POLHQ9Y253 713 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 RFPL3O75679 317 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 SHC1P29353 583 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 PPM1AP35813 382 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 OR8H3Q8N146 312 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 OR11H4Q8NGC9 324 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 OR8K5Q8NH50 307 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 DIO2Q92813 273 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 DEFB118Q96PH6 123 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 DHRS9Q9BPW9 319 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 MED20Q9H944 212 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 PRRT4C9JH25 899 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CHST10O43529 356 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 EFCAB14O75071 495 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 TBXA2RP21731 343 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 BTCP35070 178 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CPOQ8IVL8 374 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 NRMQ8IXM6 262 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 GPR135Q8IZ08 494 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 PIGXQ8TBF5 258 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CAMK1GQ96NX5 476 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 XKR8Q9H6D3 395 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CHST2Q9Y4C5 530 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ATG4BQ9Y4P1 393 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 C4orf51C9J302 202 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 BTN3A3O00478 584 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 AHRP35869 848 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 C9orf64Q5T6V5 341 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 LRRC3BQ96PB8 259 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CBLCQ9ULV8 474 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1W2PR48 441 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 HIDE1A8MVS5 230 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CLCNKAP51800 687 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 RPA4Q13156 261 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 HSD17B8Q92506 261 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ARMC5Q96C12 935 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC120Q96HB5 630 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 FAIM2Q9BWQ8 316 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 SLC38A1Q9H2H9 487 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 ZFP64Q9NPA5 681 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 COQ3Q9NZJ6 369 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 RNF13O43567 381 aa25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
FAM149A-201ENST00000227065 CXCL3P19876 107 aa25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms