RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Serpinb9fQ80UK5 377 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nudt15Q8BG93 170 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MdficQ8BX65 247 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fem1abQ8C0T1 654 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gramd1cQ8CI52 457 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mrgpra1Q91WW5 304 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 BniplQ99JU7 328 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mrpl54Q9CPW3 135 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zswim2Q9D9X6 631 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hcar2Q9EP66 360 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cdc20Q9JJ66 499 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sars2Q9JJL8 518 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gabrr3B2RXA8 464 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mthfd2lD3YZG8 338 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r101E9PZS9 857 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Htr1bP28334 386 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr6P34986 316 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd38P56528 304 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Map3k8Q07174 467 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trim63Q38HM4 350 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ankrd37Q569N2 159 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gramd2bQ6PEM6 445 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hsfy2Q80Y37 392 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trmt12Q8BG71 446 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sephs1Q8BH69 392 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd99l2Q8BIF0 237 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc6a17Q8BJI1 727 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ncr1Q8C567 325 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lsm14aQ8K2F8 462 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 St7lQ8K4P7 559 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Paip1Q8VE62 400 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 DiabloQ9JIQ3 237 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc6a14Q9JMA9 638 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 A6H6Q4 206 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RbpjlO08674 515 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Matn3O35701 481 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pdlim3O70209 316 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Srp54P14576 504 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Riiad1Q3KNY5 119 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Clcn4Q61418 747 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 EngQ63961 653 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hist2h2abQ64522 130 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 TiparpQ8C1B2 657 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prps1l1Q8C5R8 318 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Phf21bQ8C966 487 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Csnka2ipQ8CH19 720 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r219Q8R271 312 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Camkk1Q8VBY2 505 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr569Q8VGZ2 314 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rab40bQ8VHP8 278 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Serpinb9gQ8VHQ1 377 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cdc42ep1Q91W92 409 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r29Q9EQ41 303 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wdr61Q9ERF3 305 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ClpxQ9JHS4 634 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Htra1Q9R118 480 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Srpk3Q9Z0G2 565 aa8□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm16432A0A0A6YXX9 775 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Igkv10-95A0A0G2JFY3 115 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1034A0A1L1ST14 310 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1247A2AT78 314 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pgm2A2CEK3 580 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Aadacl2B2RWD2 401 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 5830473C10RikF8VQ07 620 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 DctP29812 517 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Eci1P42125 289 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 SnupnQ80W37 358 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pamr1Q8BU25 720 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Il23rQ8K4B4 644 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tex46Q9CPU3 165 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ankle1A8VU90 534 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm6465F7A7Y6 181 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Smim22J3QP37 91 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc22a1O08966 556 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fmo1P50285 532 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vdac3Q60931 283 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zik1Q80YP6 463 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc25a12Q8BH59 677 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Baiap2Q8BKX1 535 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 B4gat1Q8BWP8 415 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gpr18Q8K1Z6 331 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Med9Q8VCS6 142 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr160Q8VGE3 309 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 4931417E11RikQ9CR05 305 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trim2Q9ESN6 744 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 DptQ9QZZ6 201 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ate1Q9Z2A5 516 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wdr81Q5ND34 1934 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mamdc4A2AJA7 1228 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 H60cB1B213 197 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r184E9Q2N4 314 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm3636E9Q5P1 227 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 H2-EaP01904 255 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 P04224 255 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cxcr4P70658 359 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rnf223Q3UV31 285 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ParpbpQ6IRT3 573 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Znf182Q6P560 627 aa7.99□□□□□ -1.13
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Itih5Q8BJD1 952 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.6 ms