RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CD300AQ9UGN4 299 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 B4DXG7 233 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SLC1A7O00341 560 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 WNT10BO00744 389 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 DPM1O60762 260 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 HOXC13P31276 330 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ENTPD1P49961 510 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 EFNA3P52797 238 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 KCNAB2Q13303 367 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PLGLAQ15195 96 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM198Q66K66 360 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SLC51BQ86UW2 128 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 FOXJ1Q92949 421 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 TEPSINQ96N21 525 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 LHX6Q9UPM6 363 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 A0A1W2PPL8 197 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 HLA-DOBP13765 273 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MAGP20916 626 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 FNTBP49356 437 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 GRM7Q14831 915 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 AMZ1Q400G9 498 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 GJD2Q9UKL4 321 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 HHLA2Q9UM44 414 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MROH6A6NGR9 719 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 GABARAPH6UMI1 98 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ARHGAP33O14559 1287 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OR7A17O14581 309 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 GABARAPO95166 117 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 KCNJ5P48544 419 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CD81P60033 236 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 TEKQ02763 1124 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SLC51AQ86UW1 340 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZFP90Q8TF47 636 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PIGQQ9BRB3 760 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 FZD8Q9H461 694 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 NANOGQ9H9S0 305 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CPA4Q9UI42 421 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CD53P19397 219 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CALCRP30988 508 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 SNCAP37840 140 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CAV2P51636 162 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 BTG1P62324 171 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CXCL9Q07325 125 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 COX19Q49B96 90 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 DCUN1D4Q92564 292 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 NT5C3BQ969T7 300 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ADAM19Q9H013 955 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 A0A0G2JLW4 131 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 E7ESA3 106 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PYCR1P32322 319 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF136P52737 540 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 ARSHQ5FYA8 562 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 XKR5Q6UX68 686 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM139Q8IV31 216 aa6.05□□□□□ -1.44
SCN2A-209ENST00000636071 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms