RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTA2P62736 377 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTG2P63267 376 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 KEAP1Q14145 624 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNJQ5T5M9 372 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM151AQ8N4L1 468 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 UBTD2Q8WUN7 234 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRN3Q9H3W5 708 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF69Q9UC07 566 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 HTR3EA5X5Y0 456 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFB2O95178 105 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 LEG1Q6P5S2 330 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PRR22Q8IZ63 422 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 DTX3Q8N9I9 347 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF583Q96ND8 569 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TRPV4Q9HBA0 871 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TBX21Q9UL17 535 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R3DO95685 299 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM240Q5SV17 173 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TMPRSS12Q86WS5 348 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 OR2L8Q8NGY9 312 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC115Q96NT0 180 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CRB3Q9BUF7 120 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 MTHFD2P13995 350 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 S100A1P23297 94 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ADH7P40394 386 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 RPS15P62841 145 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 UGT2A3Q6UWM9 527 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC80Q76M96 950 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM46Q7Z4K8 759 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 HORMAD2Q8N7B1 307 aa19.51■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CCSMST1Q4G0I0 132 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SYCE2Q6PIF2 218 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM217AQ8IXS0 508 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM239Q8WW34 195 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PHOX2BQ99453 314 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC19A2O60779 497 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 LSAMPQ13449 338 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 OR8J2Q8NGG1 315 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 OR4C15Q8NGM1 316 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR78Q96P69 363 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 OR14I1A6ND48 311 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA0355O15063 1070 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 IGLV3-27P01718 113 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 RLN2P04090 185 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 MS4A15Q8N5U1 240 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 POT1Q9NUX5 634 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa19.5■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 C12orf71A8MTZ7 269 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 CR2P20023 1033 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 UGT8Q16880 541 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 FUNDC1Q8IVP5 155 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 OR9A4Q8NGU2 314 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 NXPE3Q969Y0 559 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 RFT1Q96AA3 541 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 PRRC1Q96M27 445 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 MCOLN1Q9GZU1 580 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 UCKL1Q9NWZ5 548 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ECM29Q5VYK3 1845 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAV6A0A075B6T7 132 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 H0YGG7 62 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 TAPBPO15533 448 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SLCO2B1O94956 709 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR75O95800 540 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SYPP08247 313 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 GNG2P59768 71 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 DCST2Q5T1A1 773 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 GRPEL2Q8TAA5 225 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 GGT2P36268 569 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 YPEL5P62699 121 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD54Q6NXT1 300 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 Q8N402 240 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 OR52R1Q8NGF1 315 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 HDAC8Q9BY41 377 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 MED11Q9P086 117 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNGR4O95473 234 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 OTX2P32243 289 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF84P51523 738 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 FCRLBQ6BAA4 426 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 BMFQ96LC9 184 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 P2RY12Q9H244 342 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 DHDHQ9UQ10 334 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 BCORQ6W2J9 1755 aa19.49■□□□□ 0.71
PTPRJ-208ENST00000615445 AIFM1O95831 613 aa19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms