RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 BMXP51813 675 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PGDP52209 483 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL38P63173 70 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PWP1Q13610 501 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 IMPG1Q17R60 797 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 BTBD16Q32M84 506 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD34AQ69YU3 496 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 XAF1Q6GPH4 301 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 MED27Q6P2C8 311 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ABHD13Q7L211 337 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 MMP21Q8N119 569 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 OR10A6Q8NH74 314 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 CMTM3Q96MX0 182 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 TBCDQ9BTW9 1192 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 LHPPQ9H008 270 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR54Q9H977 334 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 NECTIN3Q9NQS3 549 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 C5AR2Q9P296 337 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 FHP07954 510 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 INHBBP09529 407 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 GGT1P19440 569 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 AHRP35869 848 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PIGAP37287 484 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PIGFQ07326 219 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC13A2Q13183 592 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 THAP5Q7Z6K1 395 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2T12Q8NG77 320 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 METTL21AQ8WXB1 218 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF583Q96ND8 569 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 TUBA1CQ9BQE3 449 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 IKZF5Q9H5V7 419 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 LANCL2Q9NS86 450 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 TBCCD1Q9NVR7 557 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 CORINQ9Y5Q5 1042 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC22A7Q9Y694 548 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD28O15084 1053 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN9O75954 239 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 CRHBPP24387 322 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 SSR2P43308 183 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 BCL2A1Q16548 175 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 C18orf63Q68DL7 685 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ABHD17CQ6PCB6 329 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 MED25Q71SY5 747 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 CA13Q8N1Q1 262 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 SDCCAG3Q96C92 435 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PIP5K1AQ99755 562 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 C12orf4Q9NQ89 552 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 G3V2T6 193 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 H0YIG0 161 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 GSTA4O15217 222 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCB7O75027 752 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 SEC14L2O76054 403 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS23O95084 383 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 BCL10O95999 233 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 CST1P01037 141 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAF3Q13114 568 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 MEP1AQ16819 746 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNT18Q6P9A2 607 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC116Q8IYX3 515 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 MVB12AQ96EY5 273 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 EFCAB11Q9BUY7 163 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 DGCR6LQ9BY27 220 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNHIT1O43257 154 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 TMBIM6P55061 237 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PCOLCEQ15113 449 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC15A4Q8N697 577 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 ACOT4Q8N9L9 421 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 NT5CQ8TCD5 201 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 NRBF2Q96F24 287 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 MS4A8Q9BY19 250 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-209ENST00000607882 PRDM7Q9NQW5 492 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms