RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 CAPGP40121 348 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ERFP50548 548 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 NUDT2P50583 147 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 CDH15P55291 814 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 OR4D2P58180 307 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 CEACAM7Q14002 265 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 NSDHLQ15738 373 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 DGUOKQ16854 277 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 MIDNQ504T8 468 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 SUSD1Q6UWL2 747 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 SNX20Q7Z614 316 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 LINC00523Q86TU6 105 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 AQP12AQ8IXF9 295 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ELMOD2Q8IZ81 293 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 SLC38A6Q8IZM9 456 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 TMEM156Q8N614 296 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 APCDD1LQ8NCL9 501 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 CCNYQ8ND76 341 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 OR4K2Q8NGD2 314 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 MRGPRX2Q96LB1 330 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 COQ7Q99807 217 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ZNF670Q9BS34 389 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 TRIM15Q9C019 465 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 MUC13Q9H3R2 512 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 WDR41Q9HAD4 459 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 GLOD4Q9HC38 313 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 HCN3Q9P1Z3 774 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 VTI1BQ9UEU0 232 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 NDRG3Q9UGV2 375 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 MID2Q9UJV3 735 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ZNF221Q9UK13 617 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 WIF1Q9Y5W5 379 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 HEATR5AQ86XA9 2040 aa10.67□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 DOCK7Q96N67 2140 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 AHRRA9YTQ3 701 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 G3V3Y1 287 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 VPS26AO75436 327 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 SNX4O95219 450 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 CCKARP32238 428 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 CD68P34810 354 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 DDOSTP39656 456 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 MAGEA6P43360 314 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 AVPR1BP47901 424 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 MS4A2Q01362 244 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ATP6AP1Q15904 470 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 IL17RELQ6ZVW7 336 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 SLC29A1Q99808 456 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 CIB1Q99828 191 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 FAM173AQ9BQD7 235 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 LDAHQ9H6V9 325 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 LIN7BQ9HAP6 207 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 PRSS21Q9Y6M0 314 aa10.66□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 H0YC42 278 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 PDPK1O15530 556 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 PLIN3O60664 434 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ADAM11O75078 769 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 UPK1BO75841 260 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 AP2A2O94973 939 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 KITP10721 976 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ITGA2P17301 1181 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ITGALP20701 1170 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 RBL1P28749 1068 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 RAD23AP54725 363 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 IKZF1Q13422 519 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 SLC10A1Q14973 349 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 NRF1Q16656 503 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 BBS9Q3SYG4 887 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 MSS51Q4VC12 460 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 AGAP6Q5VW22 663 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 MAVSQ7Z434 540 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 BTLAQ7Z6A9 289 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 CPNE8Q86YQ8 564 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 SLC22A15Q8IZD6 547 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 DHRSXQ8N5I4 330 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 RFLNBQ8N5W9 214 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 ZNF441Q8N8Z8 693 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 MCUQ8NE86 351 aa10.65□□□□□ -0.7
HCG18-241ENST00000602290 OR13C4Q8NGS5 318 aa10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms