RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf27AQ580R0 203 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CDC73Q6P1J9 531 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXL6Q8N531 539 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MORN4Q8NDC4 146 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 AP3S1Q92572 193 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RSC1A1Q92681 617 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ELP4Q96EB1 424 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 C12orf49Q9H741 205 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNK12Q9HB15 430 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SMURF1Q9HCE7 757 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ALPK3Q96L96 1907 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM129A0AVI4 362 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 GLOD5A6NK44 160 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 GRXCR1A8MXD5 290 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC31A1O15431 190 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 LATO43561 262 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CSO75390 466 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP7B1O75881 506 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SOX30O94993 753 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 HMGN1P05114 100 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPAN19P0C672 248 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ACP2P11117 423 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 DRD1P21728 446 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MMP11P24347 488 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ACTR1BP42025 376 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RORCP51449 518 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB8AP61006 207 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ACTR1AP61163 376 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 YPEL5P62699 121 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK5Q00535 292 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FUT5Q11128 374 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 DECR1Q16698 335 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SYT14P1Q58G82 188 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MFSD12Q6NUT3 480 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SYCE2Q6PIF2 218 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PARM1Q6UWI2 310 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MRGPREQ86SM8 312 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 AMER3Q8N944 861 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SETD6Q8TBK2 473 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PMM1Q92871 262 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 UFD1Q92890 307 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TP53INP1Q96A56 240 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TMCO6Q96DC7 493 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 LRR1Q96L50 414 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR5M11Q96RB7 305 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 NRTNQ99748 197 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 COQ7Q99807 217 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC30A2Q9BRI3 323 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CENPOQ9BU64 300 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 AICDAQ9GZX7 198 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CERS4Q9HA82 394 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 LYRM4Q9HD34 91 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 EQTNQ9NQ60 294 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms