RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PINK1Q9BXM7 581 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 FUT8Q9BYC5 575 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 RTN4RQ9BZR6 473 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF122Q9H9V4 155 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 FLRT3Q9NZU0 649 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF337Q9Y3M9 751 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10H1Q9Y4A9 318 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf97H3BN30 126 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC14L5O43304 696 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 EMC8O43402 210 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PLOD3O60568 738 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD3B1P14060 373 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD3B2P26439 372 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ5P48544 419 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PSG6Q00889 435 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCQ05315 142 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF610Q8N9Z0 462 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 FNDC9Q8TBE3 224 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PAFAH2Q99487 392 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A3Q9BRY0 314 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ACPTQ9BZG2 426 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MED11Q9P086 117 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF21O75509 655 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CD8BP10966 210 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN20P56880 219 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 STX5Q13190 355 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 C20orf204Q6ZNR8 217 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM9CQ8IZT9 166 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf78Q8WTQ4 265 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 APIPQ96GX9 242 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R9Q9NYW1 312 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SENP1Q9P0U3 644 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BML4 177 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 FADS1O60427 444 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT6AP02538 564 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT6BP04259 564 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CASQ1P31415 396 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT6CP48668 564 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR6P50406 440 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINB9P50453 376 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PON3Q15166 354 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 GUSBP1Q15486 140 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2D4BQ5SQS7 431 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD34AQ69YU3 496 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 EBPLQ9BY08 206 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 GIMAP4Q9NUV9 329 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF175Q9Y473 711 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.293e-16■□□□□ 9.2
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2M5A3KFT3 312 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM49D1C9J1S8 452 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 GANABQ14697 944 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 HEPACAMQ14CZ8 416 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 RASA2Q15283 850 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS53Q2L4Q9 553 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC50Q53HI1 259 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 RELL1Q8IUW5 271 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 GSX2Q9BZM3 304 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 INAFM1C9JVW0 142 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SUPT7LO94864 414 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PTH2RP49190 550 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF678Q5SXM1 525 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX35Q5T0J7 233 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 C8orf74Q6P047 294 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAKDQ8WVC6 231 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM237Q96Q45 408 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF382Q96SR6 550 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL4Q9C0H6 718 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 PROCRQ9UNN8 238 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCG2Q9UNQ0 655 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 COQ9O75208 318 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ULK1O75385 1050 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 AQP8O94778 261 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 MPIP34949 423 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSM2AQ08AH3 577 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 FGFBP1Q14512 234 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 SPIN4Q56A73 249 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSM2BQ68CK6 577 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL25Q8N6Q8 603 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFBPL1Q8WX77 278 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01387J3KSC0 135 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-211ENST00000590874 THBDP07204 575 aa23.04■■□□□ 1.28
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