RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 NTN1O95631 604 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CT45A8P0DMV1 189 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CT45A9P0DMV2 189 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL32P24001 234 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 AGTR1P30556 359 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 TTKP33981 857 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CDH11P55287 796 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CORO7P57737 925 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUSP2Q05923 314 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CUL3Q13618 768 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 EFR3AQ14156 821 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CR1LQ2VPA4 569 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 NUDT13Q86X67 352 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM139Q8IV31 216 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 C3orf56Q8N813 242 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 NAT9Q9BTE0 207 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CBLN4Q9NTU7 201 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRODH2Q9UF12 536 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CES1P1Q9UKY3 287 aa9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 VWC2LB2RUY7 222 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 LY6HO94772 140 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 VENTXO95231 258 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 TGFAP01135 160 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 ATP1B1P05026 303 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CD1DP15813 335 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 PCSK2P16519 638 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 FEN1P39748 380 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 PNLIPRP2P54317 469 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPX6P59796 221 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 GGTLC2Q14390 218 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 P2RY6Q15077 328 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 PPM1NQ8N819 430 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR10D3Q8NH80 312 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 EXT2Q93063 718 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CFAP36Q96G28 342 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 BTBD9Q96Q07 612 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 RTN4RQ9BZR6 473 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 GLRX2Q9NS18 164 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A0G2JK05 382 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 SERINC4A6NH21 518 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 E7EQL1 145 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 H7C417 338 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 K7EPI3 171 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 ABCD4O14678 606 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CXCL13O43927 109 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 ADAP00813 363 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 TUBBP07437 444 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CSF3P09919 207 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC166P0CW27 439 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL12BP29460 328 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CXCR5P32302 372 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 EVI2BP34910 448 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 DEFA6Q01524 100 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 STX5Q13190 355 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 LTB4RQ15722 352 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 NPSR1Q6W5P4 371 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 GALNT10Q86SR1 603 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC25Q86WR0 208 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 MUC15Q8N387 334 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 BANPQ8N9N5 519 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 C3orf49Q96BT1 292 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 NXNL1Q96CM4 212 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 ADGRG7Q96K78 797 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 SOX7Q9BT81 388 aa9.25□□□□□ -0.93
CTDNEP1-202ENST00000570380 MCMBPQ9BTE3 642 aa9.25□□□□□ -0.93
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