RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558649.5

RABGGTA-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 768 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-206ENST00000558649 TRPC1P48995 793 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 CASP9P55211 416 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 42.7
RABGGTA-206ENST00000558649 STX5Q13190 355 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 CCNJQ5T5M9 372 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SLC30A6Q6NXT4 461 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 PAOXQ6QHF9 649 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 FJX1Q86VR8 437 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 GNRHR2Q96P88 292 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 TINAGQ9UJW2 476 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 ESPL1Q14674 2120 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 A0A0G2JND7 137 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 C17orf51A8MQB3 221 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SCN2BO60939 215 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 KCNK2O95069 426 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 UTS2O95399 124 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 PTGS2P35354 604 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 MAP3K8P41279 467 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 CASP6P55212 293 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SNTA1Q13424 505 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SLC10A1Q14973 349 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 C3AR1Q16581 482 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 CDC73Q6P1J9 531 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 TMEM81Q6P7N7 255 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 CCDC115Q96NT0 180 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 PANX1Q96RD7 426 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 INPP5KQ9BT40 448 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SERHLQ9NQF3 203 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 HRH3Q9Y5N1 445 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 RELNP78509 3460 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SNPHO15079 494 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 IL6P05231 212 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 GSNP06396 782 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 TPOP07202 933 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 KRT16P08779 473 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 STSP08842 583 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 MATN1P21941 496 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 UQCRC2P22695 453 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 CDKN2CP42773 168 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 MAN2A2P49641 1150 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 C4orf17Q53FE4 359 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 ZAR1Q86SH2 424 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 CD163Q86VB7 1156 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 VPS33AQ96AX1 596 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 OR7D2Q96RA2 312 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 STACQ99469 402 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 BTBD2Q9BX70 525 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 PIGUQ9H490 435 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-206ENST00000558649 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms