RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	KCNH1	O95259	989 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	C6orf47	O95873	294 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	IL6	P05231	212 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ABO	P16442	354 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	S100A3	P33764	101 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PIGA	P37287	484 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CASP6	P55212	293 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	WNT3	P56703	355 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	HBA1	P69905	142 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	GAB1	Q13480	694 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	NNAT	Q16517	81 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF597	Q96LX8	424 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ADAM10	O14672	748 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SUSD5	O60279	629 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SLC22A3	O75751	556 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	IL33	O95760	270 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	IGHG3	P01860	377 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PGR	P06401	933 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ALOX5	P09917	674 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	GABRA3	P34903	492 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PTGS2	P35354	604 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	DCT	P40126	519 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	IDH3A	P50213	366 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PRKAG1	P54619	331 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	UFM1	P61960	85 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SLC10A1	Q14973	349 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CDC73	Q6P1J9	531 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PRR22	Q8IZ63	422 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	GPR151	Q8TDV0	419 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	RILP	Q96NA2	401 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	OR52B2	Q96RD2	323 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	PIGU	Q9H490	435 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	MEMO1	Q9Y316	297 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1B0GVC2	190 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	OR14I1	A6ND48	311 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	DUXA	A6NLW8	204 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	PRRG2	O14669	202 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	HCN1	O60741	890 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	ICOSLG	O75144	302 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	AGR2	O95994	175 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	TPO	P07202	933 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	NGFR	P08138	427 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	CELA3A	P09093	270 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	UQCRC2	P22695	453 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	MAGEA5	P43359	124 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	MAGEA8	P43361	318 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	MASP1	P48740	699 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	AQP5	P55064	265 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	STX1B	P61266	288 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	PHC1	P78364	1004 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	TP53BP2	Q13625	1128 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	CDSN	Q15517	529 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	SZRD1	Q7Z422	152 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RBM23-231	ENST00000557549	EID3	Q8N140	333 aa		11.27	□□□□□ -0.61

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